Khoảng 95.000 điểm bỏ phiếu mở cửa từ 8 giờ đến 20 giờ (giờ Moskva, 12:00 đến 24:00 giờ Hà Nội), đảm bảo sẵn sàng mọi điều kiện an ninh và trật tự để cử tri thực hiện quyền và nghĩa vụ công dân của mình, trừ tại một số vùng như Kamchatka và Chukotka các điểm bỏ phiếu đã hoạt động từ 23 giờ ngày 17/9.
Sau 13 năm, bầu cử Quốc hội Nga 2016 quay lại tiến hành theo hệ thống hỗn hợp, một nửa (225 đại biểu) được bầu theo danh sách của 14 chính đảng đăng ký, một nửa được bầu theo danh sách phổ thông đầu phiếu tại các khu vực một đại biểu. Các chính đảng phải giành được 5% phiếu ủng hộ mới có ghế trong Duma.
Giới quan sát dự báo bốn đảng nắm ghế chính trong Duma quốc gia Nga khóa VII vẫn sẽ là đảng cầm quyền "Nước Nga Thống nhất”, “Đảng Cộng sản Liên bang Nga” (KPRF), “Dân chủ-Tự do Nga” (LDPR) và “Nước Nga công bằng” (SR).
Cũng trong ngày này, cử tri còn bầu ra thống đốc của 9 khu vực, đại biểu hội đồng lập pháp của 39 chủ thể, khoảng 5.000 thành phố cũng bỏ phiếu bầu người đứng đầu. Ủy ban bầu cử trung ương Nga đánh giá, đây là đợt bầu cử quy mô lớn nhất trong lịch sử nước Nga hiện đại.
Cuộc bầu cử diễn ra trong bối cảnh kinh tế Nga gặp nhiều khó khăn do các biện pháp trừng phạt của phương Tây về vấn đề Crimea. Đảng "Nước Nga Thống nhất" của Tổng thống Nga Vladimir Putin được dự báo sẽ giành chiến thắng bởi uy tín của nhà lãnh đạo này vẫn duy trì ở mức cao, khoảng 80% tỷ lệ ủng hộ.
Các kết quả thăm dò ngoài phòng bỏ phiếu đầu tiên sẽ được công bố vào 21 giờ giờ cùng ngày theo giờ Moskva, trong khi kết quả sơ bộ sẽ được Ủy ban bầu cử Trung ương thông báo đến cử tri vào 10 giờ sáng 19/9.