Theo đánh giá sơ bộ, bão Rafael đã gây thiệt hại nặng về cơ sở hạ tầng và sản xuất nông nghiệp tại các tỉnh miền Tây Mayabeque, Artemisa và thủ đô La Habana.
Ủy ban điện lực quốc gia Cuba thông báo bão Rafael đổ bộ vào Cuba kèm theo gió mạnh và mưa to đã khiến hệ thống điện năng bị sập hoàn toàn vào chiều 6/11 (theo giờ địa phương). Hiện tại, cơ quan này đang nỗ lực khôi phục một phần hệ thống cung cấp tại các địa phương bị ảnh hưởng.
Bên cạnh đó, Bộ trưởng Y tế Cuba, José Ángel Portal Miranda, cho biết cơ quan này đang áp dụng các biện pháp để đảm bảo các dịch vụ cơ bản cho người dân. Bộ Y tế cũng công bố các biện pháp dịch tễ để phòng ngừa bùng phát dịch bệnh.
Theo ước tính ban đầu, bão Rafael đã ảnh hưởng đến trên 4 triệu người dân Cuba. Đây là cơn bão mạnh thứ 2 trong vòng 3 tuần qua đổ bộ vào Cuba, sau bão Oscar. Cơ quan Phòng vệ dân sự Cuba xác nhận bão Oscar đổ bộ vào miền Tây nước này đã khiến ít nhất 8 người đã thiệt mạng, hàng nghìn người phải sơ tán, hơn 1.000 ngôi nhà bị hư hại, gây nhiều thiệt hại về cơ sở hạ tầng khác.