Chuyến VN1 được khai thác bằng máy bay lớn nhất của Vietnam Airlines là Boeing 787-10, chở hành khách chủ yếu là là trẻ em dưới 18 tuổi, người cao tuổi, người có bệnh nền, du học sinh không có nơi lưu trú do ký túc xá đóng cửa… hồi hương.
Trước đó, chuyến bay chiều đi từ Việt Nam chở theo một số công dân Mỹ về nước, cùng hơn 2 tấn khẩu trang được Vietnam Airlines hỗ trợ UBND TP Hà Nội vận chuyển miễn cước.
Trở về từ vùng dịch, chuyến bay tiếp tục tuân thủ những quy định nghiêm ngặt nhất về phòng chống dịch bệnh. Toàn bộ hành khách, phi hành đoàn đều mặc đồ bảo hộ y tế toàn thân và được đo thân nhiệt trước khi lên tàu. Để hạn chế khả năng lây nhiễm qua vật tiếp xúc nhiều lần, chuyến bay chỉ phục vụ đồ ăn đóng gói sẵn và dụng cụ ăn uống dùng 1 lần.
Vietnam Airlines triển khai tổ bay gần 30 người, lớn gần gấp 1,5 lần so với các chuyến đường dài thường lệ, nhằm đảm bảo an toàn bay và nghiệp vụ trong suốt hành trình dài xuyên lục địa. Chuyến bay khứ hồi VN1 giữa Hà Nội và San Francisco, với điểm dừng tại Alaska (Mỹ) trên chiều về, có tổng thời gian thực hiện là 33 giờ.
Ngay sau khi hạ cánh tại Nội Bài, tất cả hành khách đều được tổ chức kiểm tra sức khỏe, cách ly theo quy định. Tàu bay được khử trùng toàn bộ khoang hành khách, buồng lái trước khi tiếp tục khai thác.