Theo cơ quan công tố, các nhân chứng cho biết Rutunga là người đã đưa cảnh sát đến viện nghiên cứu nông nghiệp ISAR - nơi đối tượng này làm Giám đốc khu vực, để sát hại các nhân viên người Tutsi và những người đang ẩn náu tại đó. Các công tố viên cáo buộc Rutunga 3 tội danh gồm: diệt chủng, đồng lõa diệt chủng và tội ác chống lại loài người, đồng thời đề nghị mức án chung thân.
Rutunga đã phủ nhận cáo buộc trên, lập luận rằng đã gọi cảnh sát đến để bảo vệ trụ sở của viện nông nghiệp. Quyết định này cũng đã được ban giám đốc của ISAR thông qua.
Hội đồng xét xử gồm 3 thẩm phán đã ra phán quyết rằng không có đủ bằng chứng để chứng minh Rutunga đích thân tham gia các vụ giết người hoặc cung cấp vũ khí.
Luật sư của Rutunga cho biết sẽ làm việc với thân chủ để "thảo luận các bước tiếp theo" liên quan đến khả năng kháng cáo.
Nạn diệt chủng Rwanda, còn được biết đến dưới tên gọi Diệt chủng người Tutsi, là vụ giết người hàng loạt, do chính quyền Rwanda khi đó, chủ yếu là người Hutu lãnh đạo, nhắm tới sắc tộc Tutsi ở nước này. Ước tính từ 500.000 tới 1.000.000 người Rwanda, tức 70% dân số người Tutsi, bị sát hại trong 100 ngày diễn ra nạn diệt chủng, từ ngày 7/4 đến giữa tháng 7/1994. Bên cạnh đó, khoảng 30% số người Pygmy cũng đã bị sát hại.