Nam Phi ghi nhận trường hợp tử vong đầu tiên do COVID-19 vào cuối tháng 3/2020. Trong 7 ngày gần đây nhất, số ca tử vong mới được ghi nhận ở mức trung bình là 347 người/ngày - mức giảm đáng kể so với làn sóng thứ hai xảy ra từ cuối tháng 11/2020 đến tháng 1/2021, với số ca tử vong ghi nhận ở mức cao nhất trên 500 người.
Tính trung bình, số ca tử vong do COVID-19 tại Nam Phi ở mức khoảng 54.000 ca/năm, cao hơn tổng số người thiệt mạng vì các nguyên nhân phi tự nhiên ghi nhận vào năm 2018 - năm gần đây nhất có bảng phân tích chi tiết về nguyên nhân tử vong.
Trước khi đại dịch COVID-19 bùng phát, bệnh lao phổi là nguyên nhân gây tử vong hàng đầu tại Nam Phi, với 27.450 trường hợp trong năm 2018, trong khi bệnh đái tháo đường đứng ngay sau, với 26.879 ca tử vong.