Vào thời điểm trên tàu hỏa số hiệu SE6, đầu máy số DE19 924 do lái tàu Hà Văn Thắng điều khiểu, lưu thông theo hướng TP Hồ Chí Minh - Hà Nội khi đến km 241+195 thuộc địa bàn phường Quỳnh Thiện, thị xã Hoàng Mai đã đâm vào xe máy 36 K5 - 6333 do chị Nguyễn Thị Hường (sinh năm 1981, trú thôn Tường Cát, xã Trường Lâm, Tĩnh Gia, Thanh Hóa) điều khiển.
Cú đâm mạnh làm xe máy của chị Hường văng khỏi đường sắt khoảng 10 mét. Sau đó, chị Hường đã được nhân viên tàu SE6 đưa vào Bệnh viện Phong da liễu Trung ương đóng tại xã Quỳnh Lập, thị xã Hoàng Mai cấp cứu trong tình trạng nguy kịch.
Nguyên nhân vụ tai nạn được xác định là do nạn nhân thiếu quan sát khi băng qua đường dân sinh giao nhau với đường sắt.
Được biết, đây là lối đi dân sinh qua đường sắt nên không có biển báo hoặc nhân viên đường sắt trực.
Vụ tai nạn đã khiến hành trình của đoàn tàu SE6 bị chậm so với kế hoạch khoảng 40 phút.