Theo hãng tin Kyodo, cảnh sát Tokyo đã nhận được một cuộc gọi khẩn cấp vào lúc 19h50' (giờ địa phương) thông báo về việc một người đàn ông ở độ tuổi trung niên, xịt khí nghi là hơi cay tại lối ra phía Tây của nhà ga Shinjuku. Đối tượng đã xịt khí quanh khu vực phía Bắc lối ra nói trên của nhà ga, nơi có nhiều nhà hàng, quán bar và cửa hàng. Theo các nhân viên cứu hộ, tính mạng của những người bị ngộ độc khí không bị đe dọa.
Vụ việc xảy ra vào giờ cao điểm buổi tối tại ga Shinjuku của Công ty Đường sắt Nhật Bản, một trong những nhà ga có lưu lượng hành khách qua lại đông nhất tại thủ đô Tokyo.