Các lực lượng chức năng làm nhiệm vụ tại chốt gồm đại diện các sở, ban, ngành, địa phương: Cảng vụ hàng không tại Đồng Hới, Trung tâm Kiểm soát bệnh tật tỉnh, Cảng hàng không Đồng Hới, Sở Giao thông Vận tải tỉnh, Công an thành phố Đồng Hới, Tổ phòng chống dịch bệnh xã Lộc Ninh.
Chốt kiểm soát dịch tại Cảng hàng không Đồng Hới hoạt động 24/24 giờ theo lịch bay thực tế của các hãng hàng không. Các lực lượng chức năng tại chốt thực hiện nhiệm vụ kiểm soát y tế, kiểm tra việc thực hiện các biện pháp bảo vệ cá nhân trong phòng, chống dịch; điều tra dịch tễ tất cả người và phương tiện, nhất là người từ vùng có dịch theo các quy định của Thủ tướng Chính phủ và ngành y tế về phòng, chống dịch COVID-19.
Chốt còn thực hiện kiểm tra, giám sát người vào tỉnh Quảng Bình từ các địa phương đang thực hiện giãn cách xã hội, các địa danh đang có dịch, qua Cảng hàng không Nội Bài và Tân Sơn Nhất, nhất là các trường hợp về từ Hà Nội, TP Hồ Chí Minh… để thực hiện khai báo y tế, áp dụng các biện pháp cách ly y tế và lấy mẫu xét nghiệm bắt buộc những trường hợp nghi ngờ theo quy định. Cùng đó, xử lý và đề xuất các cơ quan chức năng xử lý các trường hợp có hành vi vi phạm về phòng, chống dịch...
Trước đó, tỉnh Quảng Bình cũng đã thiết lập hoạt động hai chốt kiểm soát phòng, chống dịch bệnh COVID-19 trên Quốc lộ 1A đặt tại phía Nam của tỉnh ở xã Sen Thủy, huyện Lệ Thủy và phía Bắc của tỉnh ở xã Quảng Đông, huyện Quảng Trạch. Cùng với hai chốt kiểm soát đặt trên Quốc lộ 1A, chốt kiểm soát phòng dịch tại Cảng hàng không Đồng Hới sẽ góp phần quan trọng trong việc triển khai hiệu quả các biện pháp kiểm soát, phòng dịch và ngăn chặn các nguy cơ dịch bệnh xâm nhập vào cộng đồng.