Trên địa bàn hiện có 13 cơ sở kinh doanh thuộc phạm vi thanh tra lần này, trong đó có 3 cơ sở nằm trong danh sách thanh tra của Bộ Tài nguyên và Môi trường. Để tránh chồng chéo, Sở thành lập đoàn thanh tra tại 10 cơ sở còn lại, gồm các nhà máy chế biến bột cá: Doanh nghiệp tư nhân Đặng Lợi, Công ty cổ phần thủy sản Sông Đốc, Công ty trách nhiệm hữu hạn Minh Phát Cà Mau, Công ty cổ phần Hùng Vương Sông Đốc, Công ty cổ phần bột cá Phú Hưng, Công ty cổ phần thủy sản Bích Khải và Nhà máy chế biến bảo quản hải sản bột cá Kim Sơn, Nhà máy chế biến bột cá Phú Lộc, Cảng cá Sông Đốc, Nhà máy chế biến thủy sản Mỹ Thuyền.
Nội dung thanh tra tập trung vào việc chấp hành các quy định của pháp luật về bảo vệ môi trường, tài nguyên nước trong niên hạn từ ngày 1/1 - 30/12/2016.
Thị trấn Sông Đốc là cửa biển lớn nhất của Cà Mau nói riêng và khu vực đồng bằng sông Cửu Long nói chung. Với các hoạt động kinh tế thủy sản phát triển, nơi đây tập trung nhiều nhà máy chế biến thủy sản, khiến tình trạng ô nhiễm môi trường và tài nguyên nước luôn diễn biến phức tạp, chưa được quản lý, xử lý hiệu quả.
Năm qua, Sở Tài Nguyên và Môi trường đã chủ động kiểm tra đột xuất nhiều cơ sở tại thị trấn Sông Đốc; qua đó tuyên truyền nhắc nhở nhiều cơ sở kinh doanh có ý thức bảo vệ môi trường trên địa bàn. Tháng 8/2016, Sở Tài nguyên và Môi trường đã tham gia Đoàn kiểm tra của Cục Bảo vệ môi trường miền Nam kiểm tra 3 cơ sở tại thị trấn Sông Đốc và đang xem xét, xử lý theo quy định.