Dưới sự chỉ đạo của Ủy ban quốc gia Ứng phó sự cố thiên tai và tìm kiếm cứu nạn, Bộ Giao thông Vận tải, Cục Hàng hải Việt Nam và Sở chỉ huy phía trước do Trung tâm Phối hợp tìm kiếm, cứu nạn Hàng hải Việt Nam trực tiếp chỉ đạo, cùng với sự phối hợp tích cực của chủ tàu là Công ty cổ phần vận tải Việt Nhật đã khẩn trương đưa ra phương án duy trì tìm kiếm trên mặt nước. Theo đó, phương án tìm kiếm được triển khai theo kế hoạch do phần mềm tìm kiếm chuyên dụng SAROPS thiết lập cho các tàu tìm kiếm mặt nước và triển khai lực lượng tìm kiếm dưới mặt nước để quyết tâm tìm kiếm 04 nạn nhân mất tích.
Lúc 9 giờ ngày 11/6, lực lượng tìm kiếm cứu nạn tại hiện trường đã phát hiện 1 đầu lưới đánh cá tại khu vực gần vị trí tàu chìm, nghi là của tàu TH 90282 TS. Nhận định đây là một đầu mối thông tin quan trọng để xác định chính xác vị trí tàu chìm, các phương án lặn tìm kiếm vị trí xác tàu đắm đã được triển khai ngay lập tức khi thời tiết tại hiện trường tốt lên vào sáng ngày 13/6.
Theo chỉ đạo của Sở chỉ huy phía trước, đội thợ lặn do chủ tàu (Công ty cổ phần vận tải Việt Nhật) thuê đến hiện trường phối hợp cùng lực lượng cứu nạn tổ chức lặn tìm kiếm. Lúc 5 giờ ngày 13/6, lực lượng tìm kiếm dưới nước tiến hành lặn tìm kiếm quanh khu vực phát hiện lưới. Sau nhiều lần nỗ lực lặn tìm kiếm với độ sâu khoảng 40 mét, lúc 9 giờ 10 phút cùng ngày, đội thợ lặn đã phát hiện xác tàu TH 90282 TS tại vị trí 19054.37N; 107003.5E.
Lực lượng cứu nạn tại hiện trường gồm các tàu chuyên dụng tìm kiếm cứu nạn của Trung tâm, tàu Annie Gas 09, tàu CBS8003 của lực lượng Cảnh sát biển vùng I, các tàu của lực lượng Hải quân, Kiểm ngư Việt Nam và lực lượng tàu cá do các địa phương Thanh Hóa, Hải Phòng. Hoạt động tìm kiếm nạn nhân mất tích gặp phải điều kiện thời tiết bất lợi do ảnh hưởng của cơn bão số 1 có tên quốc tế là NURI. Sau nhiều lần nỗ lực lặn tìm kiếm trong xác tàu, sáng ngày 14/6, đội thợ lặn đã phát hiện thi thể đầu tiên lúc 7 giờ 15 phút, liền đó là 3 thi thể được phát hiện trong sự chờ đợi nhiều giờ đồng hồ của lực lượng tìm kiếm cứu nạn và người thân nạn nhân.
Đến 8 giờ 40 cùng ngày, 4 thi thể được đưa lên tàu SAR 411 để đưa về cầu cảng Trung tâm Phối hợp tìm kiếm cứu nạn Hàng hải Việt Nam tại Hải phòng. Dự kiến tàu SAR 411 sẽ cập cầu cảng Trung tâm đưa 4 thi thể thuyền viên về bờ lúc 14 giờ 30 phút ngày 14/6/2020, đồng thời làm các thủ tục cần thiết theo quy định để bàn giao cho các cơ quan chức năng và người nhà...
Như tin TTXVN đã đưa, Tàu ANNIE GAS 09 (quốc tịch Việt Nam, số IMO: 9156797, trọng tải 3688 tấn), chủ tàu là Công ty cổ phần vận tải Việt Nhật (địa chỉ tại 151 Nguyễn Văn Thủ, phường Đa Kao, Quận 1, Thành phố Hồ Chí Minh) có hải trình từ Vũng Tàu đi Hải Phòng. Lúc 8 giờ 30 phút ngày 9/6/2020, tàu ANNIE GAS 09 va chạm với tàu cá TH 90282 TS tại tọa độ 19 độ 55 phút Bắc - 107 độ 03 phút Đông, trên tàu có 7 thuyền viên. Sau tai nạn, tàu cá TH 90282 TS bị chìm, tàu ANNIE GAS 09 cứu được 2 thuyền viên là Phạm Thế Đệ (sinh năm 1975), Vũ Văn Dương (sinh năm 1980, quê quán Thanh Hóa) và tìm kiếm được vớt được 1 thi thể là anh Nguyễn Văn Thân (sinh năm 1968), còn 4 người mất tích.