Việt Nam và Estonia có quan hệ hữu nghị truyền thống tốt đẹp. Hai nước thiết lập quan hệ ngoại giao từ năm 1992. Estonia nhiều lần khẳng định Việt Nam là đối tác ưu tiên tại khu vực Đông Nam Á, mong muốn thúc đẩy hơn nữa quan hệ hợp tác với Việt Nam. Hai nước tích cực phối hợp, ủng hộ nhau tại các diễn đàn đa phương.