Về thu ngân sách, báo cáo kiểm toán nêu rõ, dự toán thu nội địa năm 2022 của tỉnh xây dựng bằng 106,5% số ước thực hiện năm 2021, tuy nhiên số ước thực hiện năm 2021 mới chỉ bằng 79,6% số thực hiện trong năm.
Một số chỉ tiêu lập, giao dự toán thu nội địa chưa sát với khả năng thực hiện. Tại 5 huyện, thị xã, thành phố được kiểm toán, việc giao dự toán thu tiền sử dụng đất chưa sát với khả năng thực hiện, chưa bao quát hết nguồn thu...
Về công tác quản lý tiền thu sử dụng đất, tiền thuê đất, một số tổ chức hoạt động khai thác khoáng sản chưa làm thủ tục thuê đất; thông tin diện tích đất tại một Phiếu chuyển thông tin của Văn phòng Đăng ký quyền sử dụng đất tỉnh Lào Cai chưa đúng quy định dẫn đến xác định đơn giá thuê đất có thể chưa phù hợp.
Các đơn vị sự nghiệp công lập tự chủ tài chính khối tỉnh chưa làm thủ tục thuê đất theo quy định. Một số tổ chức, cá nhân được Nhà nước cho thuê đất đã bỏ địa chỉ kinh doanh nhiều năm chưa được xử lý thu hồi đất thuê. Điển hình như Chi cục Thuế khu vực Lào Cai - Mường Khương không tiếp tục xác định tiền thuê đất hàng năm cho 7 tổ chức được Nhà nước cho thuê đất đã bỏ địa chỉ kinh doanh, chưa được cơ quan nhà nước có thẩm quyền thu hồi đất là chưa đúng quy định tại Luật Đất đai.
Kiểm toán Nhà nước cũng phát hiện và kiến nghị phải điều chỉnh giảm giá trị trúng thầu gói thầu xây lắp số 04 của Dự án Trường Trung học phổ thông Dân tộc nội trú tỉnh Lào Cai với số tiền 68,8 triệu đồng. Huyện Mường Khương bố trí đủ 70% tăng thu năm 2022 làm nguồn cải cách tiền lương năm 2023 với số tiền 4,949 tỷ đồng. Huyện Bảo Yên bố trí hoàn trả nguồn phụ cấp lương theo biên chế, vị trí việc làm dùng chi trả các chế độ đảm bảo xã hội số tiền 3,073 tỷ đồng. Chủ đầu tư rà soát, tập hợp chứng chỉ chất lượng, xuất xứ của 2 Trạm biến áp T3, T4 làm cơ sở nghiệm thu theo quy định với số tiền 3,672 tỷ đồng. Sở Tài chính theo dõi nguồn kinh phí cải cách tiền lương tính tăng thêm các đơn vị số tiền 1,723 tỷ đồng.
Kiểm toán Nhà nước xác định, nguồn vốn ngân sách địa phương trong kế hoạch đầu tư công năm 2022 của UBND tỉnh chưa có danh mục dự án chi tiết trước 31/12/2021 với tổng số tiền là 1.582,469 tỷ đồng, chưa phân bổ chi tiết kế hoạch vốn trung ương hỗ trợ 100.000 triệu đồng - điều này chưa phù hợp với quy định của Luật Đầu tư công. Vẫn còn 4/5 huyện, thị xã, thành phố được kiểm toán chi tiết chưa ưu tiên bố trí vốn năm 2022 để thanh toán nợ đọng xây dựng cơ bản theo quy định. Một số dự án được bố trí vốn nhưng chưa giải ngân hoặc tỷ lệ giải ngân thấp.
Kiểm toán Nhà nước kiến nghị các đơn vị của tỉnh Lào Cai phải xử lý tài chính thông qua nộp ngân sách nhà nước các khoản thuế hơn 70 triệu đồng; thu hồi nộp ngân sách Nhà nước các khoản chi sai quy định, kinh phí thừa hơn 64,723 tỷ đồng; giảm dự toán, thanh toán năm sau 44,29 tỷ đồng. Bên cạnh đó, Kiểm toán Nhà nước còn kiến nghị một số chủ đầu tư phải có trách nhiệm giảm trừ khi thanh toán 4,13 tỷ đồng và thu hồi, nộp trả ngân sách hơn 69 triệu đồng, trường hợp không giảm trừ, thu hồi được thì xử lý trách nhiệm chủ đầu tư theo quy định.
Kiểm toán Nhà nước kiến nghị UBND tỉnh Lào Cai và các đơn vị trực thuộc được kiểm toán chấn chỉnh, rút kinh nghiệm đối với những hạn chế, tồn tại đã được chỉ ra. Đồng thời kiến nghị các đơn vị gồm Sở Tài chính, Sở Kế hoạch và Đầu tư, Kho bạc Nhà nước, Sở Tài nguyên Môi trường... tham mưu, rà soát, kiểm tra, có giải pháp xử lý các vấn đề còn tồn tại.