Theo cáo trạng, năm 2017, bị cáo Hoàng Văn Phương thành lập và làm giám đốc Công ty Việt Trung với ngành nghề chính là kinh doanh về dăm gỗ, dăm bào, gỗ cây… Từ năm 2018 - 2020, Phương thu mua gỗ cây của các doanh nghiệp trồng rừng, mua gỗ tròn cây keo của các hộ dân để chế biến dăm gỗ.
Để có hóa đơn giá trị gia tăng đầu vào khống, thực hiện hành vi trốn thuế cho Công ty Việt Trung, Phương thành lập thêm 6 công ty, nhờ người thân, quen đứng tên giám đốc.
Cơ quan công tố xác định, 6 công ty này không có hoạt động sản xuất kinh doanh. Việc thành lập công ty chỉ nhằm mục đích đủ điều kiện để phát hành hóa đơn tạo chi phí đầu vào khống cho Công ty Việt Trung.
Cụ thể, Phương đã chỉ đạo giám đốc các công ty trên ký khống hóa đơn và hợp đồng mua bán. Ngoài ra, Phương còn thuê bị cáo Nguyễn Thị Hoàng Ngân thực hiện nghiệp vụ kế toán, kê khai, báo cáo thuế cho 7 công ty trên. Ngân nhận thông tin về số liệu hàng hóa mua vào, bán ra từ Phương để hoàn hiện hợp đồng mua bán, hóa đơn, chứng từ khống liên quan, phục vụ cho việc báo cáo thuế, giúp sức cho Phương thực hiện hành vi trốn thuế.
Viện Kiểm sát xác định, từ năm 2018 - 2019, Công ty Trường Thành và Công ty Phú Hưng Lạc Thủy (công ty do Phương thành lập) đã xuất bán khống 288 hóa đơn giá trị gia tăng cho Công ty Việt Trung với tổng số tiền hơn 708 tỷ đồng. Hai bị cáo Hoàng Văn Phương và Nguyễn Thị Hoàng Ngân đã sử dụng bất hợp pháp 288 hóa đơn giá trị gia tăng trên để hạch toán hàng hóa đầu vào cho Công ty Việt Trung để tăng số tiền thuế giá trị gia tăng được miễn.
Hội đồng xét xử kết luận, các bị cáo đã thực hiện hành vi trốn thuế, gian lận thuế giá trị gia tăng, vi phạm quy định của pháp luật với tổng số tiền thuế giá trị gia tăng đã trốn là gần 63 tỷ đồng. Trong đó, bị cáo Phương giữ vai trò chủ mưu, chỉ huy việc phạm tội; còn bị cáo Ngân là đồng phạm, giúp sức tích cực cho Phương.
Quá trình điều tra, bị cáo Phương đã nộp 12,5 tỷ đồng để khắc phục hậu quả. Hội đồng xét xử đã tuyên buộc bị cáo Phương phải nộp tiếp số tiền hơn 50 tỷ đồng trốn thuế còn lại để sung công quỹ Nhà nước.