Trước đó, từ cuối năm 2018 đến đầu 2019, một vụ phá rừng nghiêm trọng xảy ra tại vùng lõi của Vườn Quốc gia Phong Nha - Kẻ Bàng, thuộc địa phận xã Thượng Trạch, huyện Bố Trạch. Qua kiểm đếm của của cơ quan chức năng, 72 cây gỗ mun và gỗ các loại đã bị chặt hạ, với tổng khối lượng hơn 100m3, trị giá hơn 2,5 tỷ đồng. Số gỗ bị khai thác trái phép thuộc trách nhiệm quản lý, bảo vệ của Trạm Kiểm lâm Thượng Trạch.
Với trách nhiệm Trưởng trạm, Nguyễn Hoài Nam không tổ chức tuần tra, kiểm tra, bảo vệ rừng theo quy định. Mặt khác, trong thời gian đó, Nguyễn Hoài Nam nhận được thông tin có một số cây gỗ ở đây bị chặt hạ, có dấu kéo, vận chuyển gỗ tại địa bàn quản lý nhưng không tổ chức kiểm tra, không báo cấp trên để xử lý.
Sau khi vụ việc bị phát giác, Nguyễn Hoài Nam đã bị cách chức Trạm trưởng Kiểm lâm Thượng Trạch. Vụ án phá rừng di sản Phong Nha - Kẻ Bàng đã bị Công an huyện Bố Trạch khởi tố, bắt giam nhiều đối tượng phá rừng.