Trình bày quan điểm tại phiên phúc thẩm, đại diện Viện Kiểm sát nhân dân Cấp cao tại Hà Nội đánh giá, bản án mà Tòa sơ thẩm tuyên phạt là có căn cứ, đúng quy định, không oan.
Đối với bị cáo Nguyễn Nhật Cảm (nguyên Giám đốc CDC Hà Nội), đại diện Viện Kiểm sát cho rằng, bị cáo Cảm có vai trò cao nhất, chịu trách nhiệm của người đứng đầu, khởi xướng và trực tiếp bàn bạc, ấn định giá thiết bị tham gia thầu. Bị cáo Cảm có học hàm Phó Giáo sư, học vị Tiến sỹ, trong quá trình điều tra xét xử đã thành thật khai báo, ăn năn hối cải; bị cáo Cảm chưa hưởng lợi vật chất từ vụ án, được CDC Hà Nội và đồng nghiệp nhiều nơi gửi đơn đề nghị Tòa phúc thẩm giảm hình phạt.
Tuy nhiên, đại diện Viện Kiểm sát đánh giá, mức hình phạt sơ thẩm 10 năm tù đối với bị cáo Cảm là có căn cứ, tương xứng với hành vi, mức độ phạm tội; đây là mức thấp nhất của khung hình phạt. Do đó, mặc dù có nhiều đơn xin giảm nhẹ, nhưng chưa có căn cứ để giảm nhẹ hình phạt cho nguyên Giám đốc CDC Hà Nội.
Đối với các bị cáo kháng cáo khác, đại diện Viện Kiểm sát cho rằng, bị cáo Nguyễn Vũ Hà Thanh với vai trò là Trưởng phòng Tài chính kế toán, thành viên Hội đồng tư vấn mua sắm, chọn giá hàng hóa/dịch vụ đã không làm tròn chức trách tham mưu giúp việc cho lãnh đạo các vấn đề liên quan tài chính đơn vị, đã trực tiếp ký và hoàn tất nhiều tài liệu liên quan đến việc hoàn thiện thủ tục đấu thầu.
Bị cáo Đào Thế Vinh (Giám đốc Công ty MST), là đơn vị trúng thầu, với động cơ vụ lợi trực tiếp xây dựng hồ sơ dự thầu, sử dụng thủ đoạn mua đi, bán lại thiết bị nhằm nâng giá bán lên đúng như giá đã thỏa thuận.
Bị cáo Nguyễn Thị Kim Dung (nguyên Trưởng phòng Tổ chức hành chính, CDC Hà Nội), với chức trách, nhiệm vụ của mình đã trực tiếp ký và hoàn tất nhiều tài liệu liên quan đến việc hoàn thiện thủ tục đấu thầu.
Bị cáo Nguyễn Ngọc Quỳnh (nguyên Trưởng phòng Kế hoạch nghiệp vụ, CDC Hà Nội) có vai trò trong việc hợp thức toàn bộ quy trình chỉ định thầu thông thường để Công ty MST trúng thầu theo giá thỏa thuận từ trước, vi phạm các quy định của Luật Đấu thầu năm 2003.
Bị cáo Nguyễn Trần Duy (nguyên Tổng Giám đốc Công ty cổ phần định giá và bán đấu giá Nhân Thành) đã lập khống thủ tục, hồ sơ thẩm định giá,... nhằm giúp CDC Hà Nội hợp thức hồ sơ để Công ty MST trúng thầu trái quy định pháp luật.
Viện Kiểm sát ghi nhận các bị cáo trong quá trình điều tra, truy tố, xét xử đã thành khẩn khai báo, ăn năn, hối lỗi. Tuy nhiên, đại diện Viện Kiểm sát cho rằng, chưa có căn cứ để giảm nhẹ hình phạt sơ thẩm. Từ đó, Viện Kiểm sát đề nghị Hội đồng xét xử phúc thẩm không chấp nhận kháng cáo, giữ nguyên hình phạt của bản án sơ thẩm đối với các bị cáo và người bị hại.
Bên cạnh đó, đại diện Viện Kiểm sát đề nghị bác đơn kháng cáo của Trung tâm CDC Hà Nội (bị hại trong vụ án) xin giảm hình phạt cho các bị cáo nguyên là cán bộ của Trung tâm.
Trước đó, vụ án đã tiến hành xét xử sơ thẩm. Chiều 12/12/2020, Tòa án nhân dân thành phố Hà Nội đã tuyên án phạt các bị cáo trong vụ án: "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng" xảy ra tại Trung tâm kiểm soát bệnh tật thành phố Hà Nội, trong đó, Nguyễn Nhật Cảm (nguyên Giám đốc) bị tuyên phạt 10 năm tù.
Các bị cáo: Nguyễn Vũ Hà Thanh (nguyên Trưởng phòng Tài chính kế toán, CDC Hà Nội) và Đào Thế Vinh (Giám đốc Công ty trách nhiệm hữu hạn Vật tư khoa học và thương mại Việt Nam - MST) cùng bị tuyên phạt 6 năm 6 tháng tù. Các bị cáo: Nguyễn Thị Kim Dung (nguyên Trưởng phòng Tổ chức hành chính, CDC Hà Nội), Nguyễn Ngọc Nhất (nhân viên Công ty trách nhiệm hữu hạn Phát triển khoa học Vitech), Nguyễn Trần Duy (nguyên Tổng Giám đốc Công ty cổ phần định giá và bán đấu giá Nhân Thành) cùng bị tuyên phạt 6 năm tù. Nguyễn Ngọc Quỳnh (nguyên Trưởng phòng Kế hoạch nghiệp vụ, CDC Hà Nội), Nguyễn Thanh Tuyền (nhân viên Công ty TNHH Thiết bị y tế Phương Đông) cùng bị tuyên phạt 5 năm tù. Hoàng Kim Thư (nguyên Kế toán trưởng, Phó Trưởng phòng Tài chính Kế toán, CDC Hà Nội), Lê Xuân Tuấn (cán bộ CDC Hà Nội) cùng bị tuyên phạt 36 tháng tù nhưng cho hưởng án treo.