Đây là lần thứ 2, Tòa án nhân dân thành phố Hà Nội đưa ra xét xử sơ thẩm vụ án này. Tại phiên xử trước đó vào ngày 17/9/2014, Tòa án nhân dân thành phố Hà Nội đã tuyên bị cáo Trần Minh Anh không phạm tội “Lừa đảo chiếm đoạt tài sản”. Tuy nhiên, sau khi Viện Kiểm sát nhân dân thành phố Hà Nội kháng nghị, tháng 11/2015, Tòa án nhân dân Tối cao đã tuyên hủy bản án sơ thẩm để tiến hành điều tra, xét xử lại.
Theo cáo trạng, đầu năm 2007, Trần Minh Anh cùng bà Bùi Thị Minh (khi đó là mẹ vợ bị cáo Minh Anh) đến Công ty cổ phần chứng khoán Bảo Việt Hà Nội mở tài khoản giao dịch chứng khoán. Bà Minh đưa hộ chiếu của mình để nhờ Minh Anh làm các thủ tục liên quan. Cùng ngày, Công ty cổ phần Chứng khoán Bảo Việt và bà Minh ký hợp đồng mở tài khoản nhưng chữ ký chủ tài khoản bên dưới là của Trần Minh Anh. Ngay ngày hôm sau, bà Minh nhận số tiền 175.870 Euro (hơn 3 tỷ đồng) do con gái là Trần Kim Ngân (ở Đức, khi đó là vợ Trần Minh Anh) gửi về. Minh Anh đã đưa bà Minh nộp số tiền trên vào tài khoản chứng khoán. Xong việc, bà Minh vào Thành phố Hồ Chí Minh ở với con trai.
Mặc dù không có giấy ủy quyền, nhưng từ ngày 25/1 đến ngày 2/7/2007, Minh Anh đến Công ty Chứng khoán Bảo Việt rút 2,1 tỷ đồng trong tài khoản mang tên bà Minh. Các chứng từ rút tiền đều do Minh Anh viết nội dung và ký tên.
Ngày 9/7/2007, lấy lý do mẹ vợ ốm, Minh Anh tiếp tục đến Công ty Chứng khoán Bảo Việt lập giấy ủy quyền “khống” để thực hiện các giao dịch liên quan đến chứng khoán. Tin tưởng khách hàng quen nên các nhân viên giao dịch của doanh nghiệp này đã xác nhận ngay vào giấy ủy quyền mà không có mặt bà Minh.
Sau đó, từ ngày 16/7/2007 đến ngày 30/1/2008, Trần Minh Anh tiếp tục thực hiện 16 lần rút tiền với tổng số 1,3 tỷ đồng. Qua điều tra đã xác định, bị cáo Minh Anh đã thực hiện 83 giao dịch khác nhau trên tài khoản mang tên bà Minh như nhận chuyển mua, bán chứng khoán, phí lưu ký, lãi tiền gửi...
Đầu năm 2008, khi bà Minh đến Công ty Chứng khoán Bảo Việt rút tiền thì được biết hơn 3 tỷ đồng trong tài khoản chỉ còn lại hơn 9 triệu đồng. Cho rằng doanh nghiệp quản lý tiền phải chịu trách nhiệm, bà Minh yêu cầu Công ty Chứng khoán Bảo Việt phải bồi thường toàn bộ số tiền trong tài khoản bị mất.
Tại phiên tòa sơ thẩm lần này, Hội đồng xét xử cho rằng có đủ căn cứ xác định bị cáo Trần Minh Anh đã sử dụng thủ đoạn gian dối là ký giả chữ ký và lập giấy ủy quyền khống của chủ tài khoản để chiếm đoạt tiền của Công ty Chứng khoán Bảo Việt… Tòa đã quyết định tuyên phạt bị cáo Trần Minh Anh 3 năm 10 tháng 26 ngày tù, bằng thời gian bị cáo bị tạm giam. Về dân sự, Tòa buộc bị cáo Minh Anh phải bồi thường cho Công ty Chứng khoán Bảo Việt hơn 1 tỷ đồng chiếm đoạt còn lại và doanh nghiệp này có nghĩa vụ bồi thường cho bà Bùi Thị Minh.