Trước đó, tại phiên toà xét xử sơ thẩm vụ án thất thoát 9.000 tỷ tại Ngân hàng Xây Dựng Việt Nam (VNCB), bà Hứa Thị Phấn đã bị Hội đồng xét xử khởi tố bị can để điều tra về các tội "Vi phạm các quy định về cho vay trong hoạt động tổ chức tín dụng" và "Cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng". Sau đó, bà Phấn có kháng cáo về quyết định này nhưng Hội đồng xét xử cấp phúc thẩm đã tuyên bác kháng cáo, giữ nguyên quyết định khởi tố.
Bà Phấn bị cáo buộc có nhiều hành vi sai phạm dẫn đến nhà băng bị âm vốn chủ sở hữu lên tới hơn 2.800 tỷ đồng, lỗ lũy kế hơn 6.600 tỷ, trước khi chuyển nhượng cho ông Phạm Công Danh (nguyên Chủ tịch Hội đồng quản trị VNCB và Tập đoàn Thiên Thanh). Việc khởi tố điều tra đối với bà Phấn được xem là giai đoạn 2 của vụ án tại VNCB.
Trước đó, hai bị can Hoàng Văn Toàn (nguyên Chủ tịch Hội đồng quản trị Ngân hàng Đại Tín) và Trần Sơn Nam (47 tuổi, nguyên Tổng giám đốc Ngân hàng Đại Tín) cũng bị bắt đầu tháng 1/2017 ở giai đoạn 2 của vụ án.