Trước đó, vào đầu tháng 2/2020, Cơ quan Cảnh sát điều tra (Công an tỉnh Đồng Nai) ra quyết định khởi tố vụ án hình sự, khởi tố bị can, ra lệnh bắt tạm giam Phạm Văn Sáng để điều tra về hành vi vi phạm quy định về đầu tư công trình xây dựng gây hậu quả nghiêm trọng theo Điều 224 - Bộ luật Hình sự năm 2015. Tuy nhiên, ông Sáng đã bỏ trốn.
Cơ quan Cảnh sát điều tra (Công an tỉnh Đồng Nai) cũng khởi tố, bắt tạm giam bốn tháng nguyên Giám đốc Trung tâm Ứng dụng công nghệ sinh học Đồng Nai Nguyễn Quang Tuấn để điều tra về hành vi vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước, gây thất thoát, lãng phí theo Điều 219 - Bộ luật Hình sự năm 2015.
Được biết, qua giám định một số dự án sản xuất nông nghiệp tại Đồng Nai, cơ quan chức năng xác định, ngân sách nhà nước bị thất thoát hơn 27 tỷ đồng. Ông Phạm Văn Sáng với cương vị Giám đốc Sở Khoa học và Công nghệ Đồng Nai, ông Nguyễn Quang Tuấn trên cương vị Giám đốc Trung tâm Ứng dụng công nghệ sinh học Đồng Nai, phải chịu trách nhiệm chính.
Tháng 7/2020, Ban Bí thư Trung ương Đảng đã thi hành kỷ luật bằng hình thức khai trừ ra khỏi Đảng đối với nguyên Tỉnh ủy viên, nguyên Bí thư Đảng ủy, nguyên Giám đốc Sở Khoa học và Công nghệ Đồng Nai Phạm Văn Sáng.
Theo kết luận của Ban Bí thư, trong thời gian giữ cương vị Giám đốc Sở Khoa học và Công nghệ Đồng Nai, ông Phạm Văn Sáng đã vi phạm rất nghiêm trọng nguyên tắc tổ chức, sinh hoạt Đảng và phẩm chất đạo đức, lối sống, vi phạm quy định của Đảng về tính nêu gương của người lãnh đạo, những điều đảng viên không được làm; vi phạm các quy định về công tác cán bộ; cố ý làm trái, vi phạm nghiêm trọng pháp luật của Nhà nước trong đầu tư, mua sắm, quản lý, sử dụng tài sản công và đầu tư, xây dựng cơ bản, gây thiệt hại lớn cho ngân sách nhà nước.
Cơ quan Cảnh sát điều tra (Công an tỉnh Đồng Nai) cho biết, nếu ông Phạm Văn Sáng không ra trình diện thì đơn vị sẽ phát lệnh truy nã trên toàn quốc.