Liên quan tới vụ án này, Viện Kiểm sát phê chuẩn Quyết định khởi tố bị can Trương Thị Bảo Trân (nhân viên Phòng Vật tư Bệnh viện Thủ Đức) để điều tra về tội "Nhận hối lộ" theo Điều 354 Bộ luật hình sự 2015; bị can tại ngoại do đang nuôi con nhỏ dưới 36 tháng tuổi. Các Quyết định khởi tố vụ án, khởi tố bị can được Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an Thành phố tống đạt vào sáng cùng ngày.
Theo điều tra ban đầu, từ tháng 2/2021 đến tháng 9/2021, Bệnh viện Thủ Đức đã mua bộ sinh phẩm xét nghiệm của Công ty Việt Á sản xuất thông qua Công ty Nam Phong với tổng số tiền gần 39 tỷ đồng (đơn giá 470.000 - 509.250 đồng/bộ) theo 1 gói thầu với hình thức chào hàng cạnh tranh và 37 gói thầu với hình thức mua sắm chỉ định thầu rút gọn. Việc Bệnh viện Thủ Đức mua bộ sinh phẩm xét nghiệm thông qua Công ty Nam Phong là theo chỉ định của Công ty Việt Á với mục đích thực tế là nâng giá trước khi bán vào Bệnh viện Thủ Đức. Công ty Nam Phong được chiết khấu từ 30 - 40% (tương đương gần 11 tỷ đồng).
Để hợp thức hóa cho hồ sơ chỉ định thầu, Công ty Nam Phong làm 3 bảng báo giá gồm: Báo giá của Công ty Nam Phong theo giá của Công ty Việt Á và bảng báo giá của 2 công ty còn lại là Công ty GENE (công ty của bạn Phạm Vũ Phong) và Công ty NP-SG (công ty do Phạm Vũ Phong thành lập và nhờ em gái Phong đứng tên) có giá cao hơn đơn giá của Công ty Nam Phong. Sau đó, Bệnh viện Thủ Đức hợp thức hóa thủ tục chỉ định thầu cho Công ty Nam Phong. Quá trình này, Phong đã đưa hối lộ cho Trân.
Việc Công ty Nam Phong nâng giá bán bộ sinh phẩm xét nghiệm do Công ty Việt Á sản xuất cho Bệnh viện Thủ Đức để hưởng chênh lệch hoa hồng gây thiệt hại cho Bệnh viện Thủ Đức và cũng là tài sản Nhà nước gần 11 tỷ đồng.
Hiện vụ án đang được mở rộng điều tra.