UBND tỉnh Sơn La giao UBND huyện Vân Hồ, UBND huyện Phù Yên chủ trì, phối hợp với các sở, ngành: Công an tỉnh, Bộ Chỉ huy quân sự, Sở Giao thông Vận tải, Sở Y tế, UBND xã Mường Men (huyện Vân Hồ) và UBND xã Mường Cơi (huyện Phù Yên) chỉ đạo các đơn vị chức năng rút toàn bộ lực lượng, cán bộ, chiến sỹ làm nhiệm vụ tại các chốt kiểm soát và cụm dân nói trên.
Cùng với đó, Sở Y tế chỉ đạo các đơn vị y tế trực thuộc thường xuyên kiểm tra, giám sát y tế sau thời điểm chấm dứt hoạt động vùng cách ly y tế.
Công an tỉnh Sơn La chỉ đạo các phòng chức năng và Công an hai huyện Vân Hồ, Phù Yên phối hợp nắm chắc tình hình dịch, đồng thời thực hiện hiệu quả các biện pháp đảm bảo công tác an ninh, trật tự trên địa bàn.
UBND hai huyện Vân Hồ và Phù Yên chỉ đạo Trung tâm Y tế huyện, UBND xã thường xuyên cập nhật diễn biến tình hình dịch để kịp thời xử lý nếu có tình huống phát sinh xảy ra.