Tại thời điểm kiểm tra vào ngày 25/9, đoàn kiểm tra phát hiện Công ty Trách nhiệm hữu hạn đầu tư và phát triển Huy Phú đang khai thác cát bằng máy hút cát tự động, hút cát lên bãi tập kết để các xe múc lên ô tô chở đi tiêu thụ. Trong quá trình kiểm tra, doanh nghiệp khai thác cát trên không có giám đốc điều hành mỏ cũng như giám đốc công ty. Đoàn kiểm tra đã làm việc với một người tên Trung (quản lý mỏ), tuy nhiên người này không hợp tác và bỏ đi.
Qua đối chiếu với giấy phép khai thác khoáng sản, Công ty Trách nhiệm hữu hạn đầu tư và phát triển Huy Phú khai thác cát nằm ngoài vị trí cho phép khoảng 50 m, độ sâu khai thác từ 3 - 4 m, diện tích đang khai thác khoảng 200 m2. Đoàn kiểm tra đã lập biên bản và yêu cầu Công ty dừng việc khai thác cát ngay tại thời điểm kiểm tra. Song phớt lờ yêu cầu của cơ quan chức năng, công ty này vẫn tiếp tục khai thác và chở cát đi tiêu thụ.
Chiều 26/9, khi phóng viên TTXVN và một số cơ quan báo chí khác có mặt tại hiện trường mỏ cát của Công ty này, vẫn có 3 xe tải vào chở cát, 1 máy xúc và 1 máy bơm cát. Khi phát hiện có phóng viên, 1 xe tải đã bỏ cát ra khỏi xe và chạy ra khỏi khu vực mỏ. Những người lái máy xúc hoặc người làm việc trong khu vực mỏ cũng rời đi.
Sau khi phát hiện doanh nghiệp tiếp tục khai thác, nhóm phóng viên đã liên lạc với lãnh đạo UBND xã Hòa Thành (đơn vị được đoàn kiểm tra liên ngành giao nhiệm vụ giám sát hoạt động của doanh nghiệp), ông Nguyễn Văn Trường, Phó Chủ tịch UBND xã Hòa Thành ghi nhận và cho biết sẽ cử lực lượng đến khu mỏ cát để kiểm tra.
Phú Yên có trữ lượng khoáng sản làm vật liệu thông thường khoảng 3 triệu m3. Thời gian qua, việc quản lý khai thác cát trên sông Đà Rằng (hay còn gọi là sông Ba) còn lỏng lẻo. Cử tri đã có nhiều ý kiến về việc cấp phép khai thác cát trên địa bàn tỉnh, tránh tác động đến môi trường ven bờ. Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Phú Yên đang đề xuất UBND tỉnh đấu giá khai thác cát, bảo đảm theo quy định của Chính phủ.