Trước đó, ngày 21/2, đoàn tàu mang số hiệu SE7 thuộc Công ty Cổ phần vận tải đường sắt Sài Gòn chạy từ Hà Nội vào TP Hồ Chí Minh, khi đến Km 537+700, thuộc địa phận thôn Long Đại, xã Hiền Ninh, huyện Quảng Ninh, thì bị một số người có hành vi dùng đá ném liên tiếp lên tàu. Hậu quả 4 tấm kính cửa sổ (3 tấm kính cố định ở hai toa tàu và 1 tấm kính di động ở toa số 11462) vỡ, gây ảnh hưởng đến hành trình của tàu, nhiều hành khách trên tàu hoảng loạn.
Tàu SE7 phải về dừng tại ga Mỹ Đức (huyện Lệ Thủy, tỉnh Quảng Bình) để làm biên bản ghi nhận hiện trường, gửi lại thông tin cho 2 ga hai đầu, phối hợp với lực lượng chức năng, các đơn vị liên quan và chính quyền địa phương để xử lý.
Ngay khi nhận được tin báo, Công an huyện Quảng Ninh đã nhanh chóng chỉ đạo, tổ chức lực lượng, phối hợp xác minh, điều tra và phát hiện một nhóm đối tượng nghi vấn gồm 9 học sinh là Hồ Văn Tr, Hồ Hải K. A, Hồ Nhật H, Hồ H, Hồ D, Hồ Văn Tr, Hồ Văn Tr (đều sinh năm 2009), Hồ Hoàng Nh.L và Hồ D (đều sinh năm 2010) đang học lớp 6, lớp 7 tại Trường Phổ thông Dân tộc nội trú huyện Quảng Ninh (thôn Long Đại, xã Hiền Ninh, huyện Quảng Ninh). Lực lượng công an đã phối hợp với nhà trường triệu tập 9 học sinh này để làm việc.
Công an huyện Quảng Ninh cho hay, qua đấu tranh bước đầu, 9 học sinh trên đã thành khẩn khai nhận toàn bộ hành vi ném đá lên tàu hỏa. Cơ quan Công an đang lập hồ sơ xử lý theo quy định của pháp luật.