Trước đó, khoảng 18 giờ ngày 3/6, tàu cá BTh 97155 TS, công suất 748 CV, hành nghề mành mực với 9 lao động do ông Văn Thanh Sỹ (sinh năm 1989, trú xã Long Hải, huyện Phú Quý) làm thuyền trưởng xuất bến Phú Quý để đi khai thác hải sản. Khi tàu di chuyển đến vị trí cách đảo Phú Quý khoảng 3 hải lý về hướng Tây Nam thì tàu bị sóng to, gió lớn làm phá nước, dẫn đến chìm tàu.
Ngay khi bị nạn, 8 ngư dân trên tàu đã nhảy xuống biển để bơi vào bờ, tuy nhiên vẫn còn 1 ngư dân là ông Trần Văn Trương (sinh năm 1988, trú tại xã Long Hải, huyện Phú Quý) bị mắc kẹt lại tại tàu. Khoảng 21 giờ ngày 3/6, tám ngư dân đã bơi vào đến bờ an toàn và trình báo sự việc với đồn Biên phòng Cửa khẩu cảng Phú Quý và đề nghị đồn Biên phòng hỗ trợ tìm kiếm ngư dân Trần Văn Trương.
Ngay sau đó, Đồn Biên phòng cửa khẩu cảng Phú Quý đã phát thông báo tìm kiếm cứu nạn đến các phương tiện đang hoạt động xung quanh khu vực tàu cá bị nạn để hỗ trợ.