Mười bị cáo bị truy tố ra tòa về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát lãng phí” theo Điều 219 Bộ luật Hình sự 2015, gồm: Tất Thành Cang (cựu Phó Bí thư Thường trực Thành ủy TP Hồ Chí Minh nhiệm kỳ 2015-2020), Trần Công Thiện (nguyên Tổng Giám đốc Công ty Xây dựng Tân Thuận), Nguyễn Văn Minh (nguyên Chủ tịch Hội đồng thành viên Công ty Xây dựng Tân Thuận), Trần Tấn Hải (nguyên Phó Tổng Giám đốc Công ty), Nguyễn Thị Ngọc Bích (nguyên Kế toán trưởng Công ty), Nguyễn Hoàng Việt (nguyên Kiểm soát viên Công ty), Nguyễn Xuân Tùng (nguyên Trưởng Phòng Kinh doanh tổng hợp), Phạm Văn Thông (nguyên Phó Chánh Văn phòng Thành ủy TP Hồ Chí Minh), Huỳnh Phước Long (nguyên Trưởng Phòng Quản lý đầu tư kinh doanh vốn, Văn phòng Thành ủy), Phan Thanh Tân (nguyên Phó Chánh Văn phòng Thành ủy).
Tại phiên tòa, Hội đồng xét xử đã triệu tập đại diện nhiều cơ quan, công ty. Trong đó, đại diện UBND Thành phố Hồ Chí Minh, giám định viên của Bộ Xây dựng, Bộ Tài Chính, đại diện các Công ty Xây dựng Tân Thuận, Công ty Quốc Cường Gia Lai có mặt; đại diện Văn phòng Thành ủy vắng mặt.
Theo cáo trạng, Công ty Xây dựng Tân Thuận được UBND huyện Nhà Bè giao đầu tư xây dựng dự án Khu dân cư Phước Kiển, xã Phước Kiển và được Văn phòng Thành ủy chấp thuận chủ trương cho đầu tư dự án. Tại dự án này, với vai trò Tổng Giám đốc Công ty Xây dựng Tân Thuận, bị cáo Trần Công Thiện đã có hành vi tổ chức và thực hiện không đúng quy định về xây dựng giá dẫn đến giá trị chuyển nhượng phần đất đã đền bù không đảm bảo nguyên tắc thị trường, công khai, minh bạch gây thất thoát tiền của Nhà nước.
Tháng 6/2017, Công ty Xây dựng Tân Thuận đã chuyển nhượng 32ha đất dự án Khu dân cư Phước Kiển cho Công ty Quốc Cường Gia Lai với giá 374 tỉ đồng, nộp tiền thuế VAT là 23 tỉ đồng. Sau đó, ngày 8/5/2017, hợp đồng trên đã bị hủy bỏ, Công ty Xây dựng Tân Thuận đã trả lại cho Công ty Quốc Cường Gia Lai toàn bộ tiền chuyển nhượng, tiền thuế VAT và thêm tiền lãi suất là 21,2 tỉ đồng. Cáo trạng xác định, các bị cáo đã gây thiệt hại cho nhà nước ở dự án này là 202,6 tỉ đồng.
Tại dự án Khu dân cư ven sông, Công ty Xây dựng Tân Thuận đã chuyển nhượng toàn bộ dự án này cho Công ty Quốc Cường Gia Lai, gây thất thoát cho Nhà nước hơn 532,6 tỉ đồng. Bị cáo Thiện có sai phạm trong việc chuyển nhượng 45% trong 55% vốn góp không đúng quy định dẫn đến giá chuyển thấp, gây thiệt hại nguồn vốn của Đảng bộ Thành phố tại Công ty. Bị cáo Nguyễn Văn Minh đã có hành vi họp bàn, thống nhất giá chuyển nhượng với Trần Công Thiện và trực tiếp ký văn bản gửi Văn phòng Thành ủy xin chủ trương chuyển nhượng vốn góp với giá được xây dựng không đúng quy định. Các bị cáo còn lại là cán bộ Công ty Xây dựng Tân Thuận bị đề nghị truy cứu trách nhiệm hình sự liên quan đến hành vi trên.
Bị cáo Tất Thành Cang (cựu Phó Bí thư Thường trực Thành ủy) đã có hành vi không báo cáo Ban Thường vụ Thành ủy mà tự ý cho chủ trương để cấp dưới thực hiện chuyển nhượng phần đất đã đền bù tại dự án Khu dân cư Phước Kiển với giá được xây dựng không đúng quy định dẫn đến giá trị chuyển nhượng thấp, gây thất thoát số tiền lớn của Đảng bộ Thành phố tại Công ty. Các bị cáo Phạm Văn Thông, Phan Thanh Tân, Huỳnh Phước Long chịu trách nhiệm cùng với bị cáo Tất Thành Cang.
Trước đó, trong vụ án sai phạm tại Công ty Trách nhiệm hữu hạn Một thành viên Phát triển công nghiệp Tân Thuận (IPC), Công ty Phát triển Nam Sài Gòn (SADECO) và các đơn vị liên quan, Tòa án nhân dân cấp cao tại TP Hồ Chí Minh đã tuyên phạt các bị cáo Tất Thành Cang 8 năm 6 tháng tù, Phạm Văn Thông 6 năm tù, Huỳnh Phước Long 12 năm tù, Trần Công Thiện 13 năm tù.