Tân cảng Cát Lái là cửa khẩu cảng biển có lượng hàng hóa thông qua lớn nhất cả nước.
Theo Nghị quyết của HĐND TP Hồ Chí Minh tại kỳ họp thứ 6 (khóa X), thành phố miễn thu phí đối với hàng hóa nhập khẩu phục vụ trực tiếp cho an ninh, quốc phòng; hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu để phục vụ đảm bảo an sinh xã hội, khắc phục hậu quả thiên tai, thảm họa, dịch bệnh. Miễn thu phí đối với hàng hóa tạm nhập tái xuất, hàng tạm xuất tái nhập, hàng gửi kho ngoại quan, hàng quá cảnh, hàng chuyển khẩu, hàng xuất khẩu, hàng nhập khẩu được vận chuyển vào cảng và rời cảng bằng phương tiện thủy nội địa hoạt động trên các tuyến đường thủy theo Hiệp định giữa Việt Nam và Campuchia về vận tải đường thủy.
Giảm 50% mức phí đối với hàng tạm nhập tái xuất, hàng tạm xuất tái nhập, hàng gửi kho ngoại quan, hàng quá cảnh, hàng chuyển khẩu, hàng xuất khẩu, hàng nhập khẩu được vận chuyển vào cảng và rời cảng bằng phương tiện thủy nội địa hoạt động trên các tuyến đường thủy.
Ông Nguyễn Ngọc Tuấn, Giám đốc Cảng vụ Đường thủy nội địa TP Hồ Chí Minh (đơn vị thực hiện thu phí) cho biết, tất cả các trường hợp thuộc đối tượng miễn thu phí phải thực hiện kê khai đầy đủ thông tin hàng hóa của tờ khai hải quan lên hệ thống thu phí để phục vụ công tác kiểm tra, giám sát thu phí. Cùng với đó, Cảng vụ đề nghị các doanh nghiệp cảng duy trì trạng thái kết nối hệ thống thực hiện kiểm tra tình trạng nộp phí với hàng hóa qua cảng; nhắc nhở người nộp phí chưa thực hiện nghĩa vụ nộp phí theo quy định.
Cuối năm 2020, HĐND TP Hồ Chí Minh thông qua Nghị quyết ban hành mức thu phí hạ tầng cảng biển, triển khai từ ngày 1/7/2021. Tuy nhiên, do ảnh hưởng của dịch COVID-19, HĐND Thành phố đã hai lần thông qua Nghị quyết lùi thời hạn thu phí và chính thức thu từ 1/4/2022.
Từ khi triển khai thu phí, các bộ ngành, hiệp hội và doanh nghiệp đã có một số ý kiến liên quan đến đối tượng thu phí và mức phí áp dụng khác nhau giữa mở tờ khai trong và ngoài TP Hồ Chí Minh cần phải điều chỉnh. Do đó, TP Hồ Chí Minh đã nghiên cứu, sửa đổi theo hướng miễn, giảm mức phí với một số đối tượng.
Theo đó, từ ngày 1/8, mức thu đối hàng tạm nhập tái xuất, hàng tạm xuất tái nhập, hàng quá cảnh là 50.000 đồng/tấn với hàng lỏng, hàng rời không đóng trong container, hàng đóng ghép chung container của nhiều chủ hàng; 2,2 triệu đồng/container loại 20ft và 4,4 triệu đồng/container 40ft.
Đối với hàng gửi khi ngoại quan, hàng chuyển khẩu được đưa vào khu vực kho bãi thuộc các cảng biển thành phố (không đưa vào kho ngoại quan và khu vực trung chuyển) cũng như hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, áp dụng mức thu 15.000 đồng/tấn cho hàng lỏng, hàng rời không đóng trong container, hàng đóng ghép chung container của nhiều chủ hàng; 250.000 đồng/container 20ft; 500.000 đồng/container 40ft.