Trên cơ sở phân tích, đánh giá tình hình đất nước, tự phê bình về những sai lầm, khuyết điểm, đổi mới tư duy lý luận trải qua nhiều tìm tòi, khảo nghiệm từ thực tiễn, Đại hội đề ra đường lối đổi mới: đổi mới cơ cấu kinh tế; Thực hiện ba chương trình kinh tế; Xây dựng và củng cố quan hệ sản xuất XHCN, sử dụng và cải tạo đúng đắn các thành phần kinh tế. Đồng chí Nguyễn Văn Linh được bầu làm Tổng Bí thư của Đảng.
Từ Đại hội VI đến Đại hội VII (12/1986 – 6/1991), sau 5 năm thực hiện đường lối đổi mới, đất nước ta đã thu được những thành tựu bước đầu rất quan trọng, chứng tỏ đường lối đổi mới do Đại hội VI đề ra là đúng đắn, bước đi của công cuộc đổi mới về cơ bản là phù hợp.