Các chốt sẽ hoạt động liên tục 24/24 giờ tất cả các ngày trong tuần (kể cả ngày nghỉ, ngày lễ), được chia làm 3 ca, bắt đầu từ 27/3. Trước đó, tỉnh đã thành lập một chốt kiểm soát trong ga xe lửa Lào Cai.
Người dân và hành khách được kiểm tra thân nhiệt tại chốt nút giao đường cao tốc Nội Bài - Lào Cai thuộc địa phận xã Xuân Giao, huyện Bảo Thắng (Km234).
Nhiệm vụ chung của các chốt là kiểm tra, kiểm soát người, phương tiện đi từ vùng dịch vào địa bàn trong vòng 14 ngày. Tất cả hành khách và người tham gia giao thông khi qua trạm đều phải khai báo sức khỏe; đo thân nhiệt; đeo khẩu trang; khử trùng tay và được tư vấn, tuyên truyền các biện pháp phòng, chống dịch bệnh. Những người có biểu hiện sốt, ho, khó thở hay phương tiện chở hàng hóa có khả năng lây truyền dịch bệnh sẽ được kịp thời phát hiện để có biện pháp ngăn chặn theo quy định.
Theo ghi nhận trong sáng 27/3, tại chốt nút giao đường cao tốc Nội Bài – Lào Cai thuộc địa phận xã Xuân Giao, huyện Bảo Thắng (Km234), tổ kiểm tra liên ngành đã kiểm tra hơn 400 phương tiện. Tất cả các hành khách, lái xe đều được hướng dẫn việc khai báo sức khỏe và kiểm tra thân nhiệt,không trường hợp bất thường nào được phát hiện.
Trong 9 chốt, trên tuyến đường cao tốc Nội Bài - Lào Cai có 3 điểm, gồm: Nút giao Văn Bàn tại Km 199 + 925 (xã Tân Thượng, huyện Văn Bàn); nút giao Xuân Giao - Bảo Thắng tại Km 234 (xã Xuân Giao, huyện Bảo Thắng) và Trạm thu phí Km 237 (xã Gia Phú, huyện Bảo Thắng).
Các điểm còn lại gồm chốt kiểm soát trên Quốc lộ 70, đoạn giáp tỉnh Yên Bái; Quốc lộ 279 (giáp tỉnh Hà Giang); Quốc lộ 279 (giáp tỉnh Lai Châu); Quốc lộ 4D, đoạn qua đỉnh Đèo Ô Quý Hồ (giáp tỉnh Lai Châu); đoạn đường từ huyện Bắc Hà (tỉnh Lào Cai) giáp huyện Xín Mần (tỉnh Hà Giang).