Trải qua nhiều năm, di tích này ngày càng xuống cấp, các tài liệu, hình ảnh trưng bày bị mờ, trầy xước, một số bị rách. Nhiều phòng giam phải đóng cửa, ngừng phục vụ khách tham quan, chỉ có phần khuôn viên bên ngoài được mở để người dân vào thắp hương… Trước tình hình đó, ngày 28/12/2023, Quận 5 tổ chức khởi công công trình. Qua 4 tháng triển khai đã hoàn thành giai đoạn 1 tu bổ, tôn tạo Di tích lịch sử cấp Quốc gia Khu trại giam Bệnh viện Chợ Quán.
Cụ thể, giai đoạn 1 đã tu bổ nhà giam theo nguyên trạng khu đất, hoàn thành nhân kỷ niệm 120 năm ngày sinh của đồng chí Trần Phú (1/5/1904 - 1/5/2024). Tiếp đó, giai đoạn 2 sẽ tập trung mở rộng diện tích và xây dựng nhà mới để tiếp đón khách tham quan Không gian văn hóa Hồ Chí Minh, nhà trưng bày các hiện vật.
Ông Dương Anh Đức, Phó Chủ tịch Ủy ban nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh cho rằng, sau khi tu bổ, tôn tạo, tổ chức trưng bày lại, Di tích lịch sử cấp Quốc gia Khu trại giam Bệnh viện Chợ Quán sẽ là công trình xứng tầm di tích quốc gia, đáp ứng nhu cầu tham quan, nghiên cứu và tìm hiểu lịch sử cách mạng của người dân thành phố nói riêng, cả nước nói chung.
Trước buổi lễ, đoàn đại biểu Thành ủy, Hội đồng nhân dân, Ủy ban nhân dân, Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam Thành phố Hồ Chí Minh do Phó Bí thư Thành ủy, Chủ tịch Hội đồng nhân dân Thành phố Nguyễn Thị Lệ làm Trưởng đoàn đã dâng hoa, dâng hương trước tượng đài Tổng Bí thư đầu tiên của Đảng Cộng sản Việt Nam Trần Phú, trong khuôn viên Khu trại giam Bệnh viện Chợ Quán.
Tổng Bí thư Trần Phú sinh ngày 1/5/1904 tại xã Tùng Ảnh (huyện Đức Thọ, tỉnh Hà Tĩnh), là Tổng Bí thư đầu tiên của Đảng Cộng sản Việt Nam từ tháng 10/1930 đến tháng 4/1931. Ông mất ngày 6/9/1931, tại Bệnh viện Chợ Quán.
Bệnh viện Chợ Quán (nay là Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Thành phố Hồ Chí Minh) xây dựng xong vào năm 1864, được Tổ chức Kỷ lục Việt Nam, đơn vị trực thuộc Trung ương Hội Kỷ lục gia Việt Nam công nhận là "Bệnh viện lâu đời nhất Việt Nam". Thời điểm bắt đầu đi vào hoạt động, bệnh viện chuyên điều trị các loại bệnh truyền nhiễm và bệnh tâm thần. Do nhu cầu điều trị bệnh tâm thần nên trong bệnh viện có xây một khu riêng biệt dành riêng cho các bệnh nhân này.