Cần phân biệt “hoạt động biên giới” với hoạt động xuất nhập khẩu chính thống. Tách bạch cơ chế quản lý, điều hành để vừa quản lý chặt chẽ hoạt động xuất nhập khẩu vừa đảm bảo sự linh hoạt, đặc thù của hoạt động thương mại biên giới. Bộ trưởng Bộ Công Thương Vũ Huy Hoàng, Trưởng ban chỉ đạo Thương mại biên giới đã chỉ đạo lực lượng chức năng địa phương như vậy tại Hội nghị giao ban công tác Ban chỉ đạo thương mại biên giới, tổ chức sáng 26/11 tại Hà Nội.
Theo báo cáo của Ban chỉ đạo Thương mại biên giới các tỉnh, tổng kim ngạch xuất nhập khẩu qua các cửa khẩu biên giới giai đoạn từ năm 2008 đến hết 9 tháng năm 2013 đạt 72 tỷ USD, tăng bình quân trên 10%/năm. Cùng với sự phát triển của mối quan hệ hữu nghị, hợp tác quốc tế - thương mại với các nước có chung biên giới, hoạt động thương mại biên giới góp phần hoàn thành mục tiêu đưa kim ngạch thương mại Việt Nam - Trung Quốc lên 60 tỷ USD, Việt Nam - Lào lên 2 tỷ USD và Việt Nam - Campuchia lên 5 tỷ USD vào năm 2015.
Tuy nhiên, theo đại diện các Ban chỉ đạo địa phương, chính sách thương mại biên giới của các nước có chung biên giới thường xuyên thay đổi nên hoạt động xuất nhập khẩu, trao đổi hàng hóa qua biên giới của Việt Nam không chủ động, có lúc bị gián đoạn.