Cụ thể, về giao thông, Quyết định nêu rõ, sẽ điều chỉnh hướng tuyến đường Quốc phòng và hướng tuyến đường bộ ven biển đi theo đường vào Khu Du lịch Bãi Lữ và đường D4 – Khu kinh tế Đông Nam (không đi qua Khu Du lịch Bãi Lữ, Bãi Tiền Phong, Bãi Hải Đồn); điều chỉnh hướng tuyến đường giao thông đối ngoại đoạn đi qua khu vực Bãi Tiền Phong (tuyến đường nối từ Bãi Lữ đi Bãi Hải Thịnh) đi sát về chân núi phía Tây Nam. Quyết định cũng điều chỉnh về sử dụng đất, chuyển đổi khu đất làng xóm cải tạo đô thị hóa, quy mô diện tích 22,63 ha tại khu vực Bãi Tiền Phong và Bãi Hải Đồn thành khu du lịch. Theo Quyết định của Thủ tướng, cần bố trí khu tái định cư cho các hộ dân vào khu đất ở đô thị tại Khu đô thị số 5; chuyển đổi khu đất trung tâm công cộng cấp đô thị, quy mô 5,98 ha thành đất công viên cây xanh thể dục thể thao.
Đồng thời, cần bố trí, sắp xếp lại khu công viên cây xanh thể dục, thể thao theo hướng tập trung trên cơ sở điều chỉnh vị trí các khu đất du lịch. Diện tích đất cây xanh, công viên, thể thao sau khi điều chỉnh dự kiến đạt khoảng 80,56 ha (tăng thêm 21,97 ha). Cùng với đó, cần bố trí, sắp xếp lại khu đất du lịch tại khu vực Bãi Tiền Phong và Bãi Hải Đồn từ phân tán sang tập trung trên cơ sở khu đất làng xóm cải tạo đô thị hóa sẽ di dời, đất cây xanh công viên thể dục thể thao và đất chưa sử dụng; bổ sung chức năng khu du lịch, quy mô diện tích 22 ha tại khu vực đất chưa sử dụng sát chân Núi Dẻ vào khu du lịch ven biển Bãi Tiền Phong. Tổng diện tích đất Khu Du lịch tại khu vực sau điều chỉnh đạt khoảng 112 ha.
Thủ tướng Chính phủ giao UBND tỉnh Nghệ An có trách nhiệm chỉ đạo cập nhật nội dung điều chỉnh cục bộ vào hồ sơ đồ án Quy hoạch chung theo Quyết định số 1534/QĐ-TTg ngày 21/10/2008 của Thủ tướng Chính phủ để quản lý thực hiện theo quy hoạch đã được duyệt; công bố công khai nội dung điều chỉnh cục bộ Quy hoạch; hồ sơ đồ án Quy hoạch sau khi được cập nhật gửi về Bộ Xây dựng để lưu giữ theo quy định.
UBND tỉnh Nghệ An có trách nhiệm tổ chức lập, phê duyệt quy hoạch phân khu xây dựng tại khu vực có các nội dung được điều chỉnh cục bộ và hướng dẫn nhà đầu tư thực hiện trình tự thủ tục đầu tư xây dựng theo quy định hiện hành, đảm bảo phù hợp với Quy hoạch chung đã được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt, đáp ứng yêu cầu phát triển kinh tế - xã hội tại Khu Kinh tế Đông Nam Nghệ An.
Bên cạnh đó, UBND tỉnh Nghệ An có trách nhiệm xây dựng biện pháp, chính sách đền bù, tái định cư đối với khu vực giải phóng mặt bằng tại xã Nghi Tiến đảm bảo quy định của pháp luật; lập kế hoạch xây dựng đồng bộ Khu đô thị số 5 gắn với khu tái định cư cho người dân, đảm bảo bố trí đầy đủ hệ thống hạ tầng kỹ thuật, hạ tầng xã hội để đáp ứng nhu cầu của người dân được tái định cư trong khu vực.
UBND tỉnh Nghệ An có trách nhiệm phối hợp với Bộ Giao thông Vận tải để đảm bảo xây dựng đồng bộ và vận hành hiệu quả tuyến đường bộ ven biển; phối hợp với Bộ Tài nguyên và Môi trường trong việc chuyển đổi đất sản xuất nông nghiệp, đất rừng, đất an ninh quốc phòng, đảm bảo tuân thủ quy định của pháp luật về đất đai và thực hiện quy định về bảo vệ môi trường.
Thủ tướng Chính phủ giao Bộ Xây dựng tổ chức kiểm tra, hướng dẫn thực hiện theo quy hoạch chung xây dựng Khu Kinh tế Đông Nam Nghệ An được phê duyệt.