Đoàn Ủy ban Paralympic Nga đã lấy lại vị trí thứ ba sau khi bị đoàn Mỹ vượt qua vào ngày 3/9. Kết thúc ngày thi đấu 4/9, đoàn Ủy ban Paralympic Nga đã có được thêm 2 HCV, nâng tổng số HCV đạt được lên 36. Đoàn Mỹ chỉ có được thêm 1 HCV và rớt xuống vị trí thứ tư với 35 HCV.
Đoàn thể thao Trung Quốc đã liên tục duy trì vị trí đứng đầu bảng xếp hạng, với tổng số huy chương đạt được khi kết thúc ngày thi đấu 4/9 là 200 huy chương, trong đó có 93 HCV. Ở vị trí số hai, đoàn thể thao Anh có được tổng số 122 huy chương, trong đó có 41 HCV. Với kết quả này, đoàn Trung Quốc chắc chắn giành vị trí đầu bảng khi Paralympic Tokyo chỉ còn một ngày thi đấu. Đoàn thể thao nước chủ nhà Nhật Bản có được thêm 1 tấm HCV của vận động viên Satomi Sarina ở nội dung cầu lông xe lăn, nâng tổng số HCV đạt được lên 9 huy chương, đứng thứ 15 trên bảng xếp hạng.
Sau 11 ngày thi đấu của Paralympic, đã có tổng cộng 86 đoàn thể thao giành được ít nhất 1 huy chương. Đoàn thể thao Việt Nam hiện xếp thứ 75, với 1 Huy chương Bạc (HCB) của vận động viên cử tạ Lê Văn Công.
Ngày thi đấu cuối cùng của Paralympic (5/9) sẽ có 5 nội dung thi đấu là marathon, cầu lông, bắn súng, bóng chuyền ngồi và bóng rổ xe lăn, với 15 bộ huy chương các loại. Lễ bế mạc Paralympic Tokyo 2020 sẽ diễn ra từ 18h (giờ Việt Nam) tại sân vận động quốc gia ở Tokyo.