Tại phiên tòa, bị cáo Nguyễn Bảo Tiên đã thành khẩn khai báo, nhận tội và ăn năn hối cải. Sau khi nghị án, Hội đồng xét xử đã tuyên phạt bị cáo 5 năm 6 tháng tù giam về tội “Tàng trữ, phát tán, tuyên truyền tài liệu nhằm chống Nhà nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam” và 1 năm tù giam về tội “Chiếm đoạt, tàng trữ trái phép vật liệu nổ”. Tổng hình phạt tù mà bị cáo Nguyễn Bảo Tiên phải nhận là 6 năm 6 tháng tù giam.
Theo Cáo trạng của Viện Kiểm sát nhân dân tỉnh Phú Yên, Nguyễn Bảo Tiên theo dõi các trang báo nước ngoài và thường xuyên chia sẻ, đăng tải các bài viết có nội dung xuyên tạc, chống Nhà nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam.
Từ tháng 8 - 10/2019, Nguyễn Bảo Tiên đã 5 lần, nhận 6 kiện hàng là các cuốn sách “Chính trị bình dân”, “Cẩm nang nuôi tù”, “Phản kháng phi bạo lực” và “Chính đề Việt Nam” của “Nhà xuất bản tự do” có nội dung xuyên tạc, tuyên truyền chống phá Nhà nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam. Đối tượng này đã 4 lần gửi 46 bưu phẩm, trong đó đã gửi thành công 24 bưu phẩm; 1 bưu phẩm đã gửi nhưng không có người nhận; đang làm thủ tục gửi 21 bưu phẩm thì bị Công an thành phố Tuy Hòa (Phú Yên) phát hiện bắt giữ. Khám xét nhà ở của Nguyễn Bảo Tiên, lực lượng chức năng phát hiện 22 bưu phẩm với 38 cuốn sách được cất giấu.
Ngày 20/4/2021, Cơ quan An ninh điều tra, Công an tỉnh Phú Yên còn phát hiện Nguyễn Bảo Tiên cất giấu 1 quả lựu đạn. Đối tượng này khai nhận khi được trưng tập tham gia diễn tập quân sự vào tháng 4/2008, đã lén lút lấy 1 quả lựu đạn có kíp nổ dùng trong huấn luyện quân sự mang về nhà.