Từ sáng đến chiều 12/9, địa bàn tỉnh Quảng Trị đã có mưa to đến rất to như: Triệu Ái (huyện Triệu Phong) gần 112mm, Đakrông (huyện Đakrông) 120mm, Mỹ Chánh (huyện Hải Lăng) trên 92mm. Dự báo mưa to đến rất to còn tiếp tục trong ngày 13/9.
Hiện nay, nguy cơ bị thiệt hại nặng nhất do mưa lũ là diện tích lúa Hè Thu 2021 chưa kịp thu hoạch. Tỉnh còn khoảng 3.700 ha lúa Hè Thu 2021 chưa thu hoạch, trong đó có hơn 500 ha đã bị đổ ngã do gió to và mưa lớn; tập trung ở các huyện: Vĩnh Linh, Gio Linh,Triệu Phong, Đakrông, Hướng Hóa và thành phố Đông Hà. Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn Quảng Trị đã chỉ đạo các địa phương khẩn trương hỗ trợ người dân thu hoạch lúa, hoa màu và diện tích nuôi trồng thủy sản; đồng thời có các biện pháp đảm bảo an toàn, hạn chế thiệt hại do ngập úng gây ra.
Tại xã Hướng Lập, huyện miền núi Hướng Hóa, mưa lớn do bão số 5 suy yếu thành áp thấp nhiệt đới đã làm sạt lở, cuốn trôi hệ thống cống tràn Sê Pu tại bản Sê Pu; ngầm tràn trên tuyến đường vào thôn Tri và bản Cuôi bị gãy cuốn trôi. Mưa lớn kéo dài khiến mực nước trên sông, suối dâng nhanh, gây ngập lụt nhiều cầu tràn ở huyện miền núi Hướng Hóa và Đakrông như ở các xã: Tà Long, Ba Nang. Bộ đội Biên phòng đã phối hợp với các địa phương bố trí lực lượng túc trực, không cho người và phương tiện lưu thông qua cầu tràn bị ngập để đảm bảo an toàn.
Xã Hải Ba, huyện Hải Lăng có 50 công trình bị ảnh hưởng bởi gió to và mưa lớn vào đêm 11/9, trong đó có 5 nhà dân bị tốc mái hoàn toàn. Huyện Hải Lăng đã huy động lực lượng hỗ trợ người dân lợp lại mái nhà, khắc phục thiệt hại và thu dọn cây xanh bị đổ ngã ở các tuyến đường.