Theo ông Lê Mạnh Hà, việc đăng ký, sử dụng thành công tài khoản định danh điện tử VNEID mức độ 2 không phụ thuộc vào việc có tích hợp được bằng lái xe vào tài khoản VNEID hay không. Tức là, người dân vẫn đăng ký, kích hoạt thành công tài khoản định danh mức độ 2 mà chưa có tích hợp bằng lái xe. Tuy nhiên, việc không tích hợp được bằng lái xe vào tài khoản VNEID làm cho tài khoản định danh VNEID thiếu đi tính tiện ích đầy đủ của tài khoản định danh điện tử mức độ 2
Qua khảo sát thực tế của Công an TP Hồ Chí Minh cho thấy, những trường hợp chưa tích hợp được giấy phép lái xe vào tài khoản định danh điện tử mức độ 2 do việc đối sánh dữ liệu dân cư của Bộ Công an và dữ liệu cấp bằng lái xe của Bộ Giao thông Vận tải không xác thực được thông tin (không trùng khớp thông tin) do một số nguyên nhân như: Thông tin cá nhân khi được cấp bằng lái xe và thông tin cá nhân trên cơ sở dữ liệu Quốc gia về dân cư hiện nay có sai lệch, thường là các trường hợp bằng lái xe cũ, loại mẫu giấy phép lái xe giấy; các trường hợp người dân được cấp giấy phép lái xe khi còn sử dụng CMND 9 số; thông tin về bằng lái xe chưa được cập nhật vào cơ sở dữ liệu của Bộ Giao thông Vận tải và chia sẻ về cơ sở dữ liệu quốc gia về dân cư để đối sánh, xác thực; bằng lái xe của ngành công an.
Đây là khó khăn chung trong yêu cầu làm sạch dữ liệu và chia sẽ dữ liệu của các bộ, ngành. Công an TP Hồ Chí Minh đã có báo cáo về Bộ Công an. Ban chỉ đạo đề án 06 Chính phủ và lãnh đạo Bộ Công an thường xuyên có các chỉ đạo và đề ra nhiều giải pháp để thực hiện.
Cũng theo Thượng tá Lê Mạnh Hà, hiện nay, Cục C06 Bộ Công an và Bộ Giao thông Vận tải đang hoàn thiện phần mềm nhằm cung cấp công cụ cho phép người dân tự đối soát, đồng bộ dữ liệu về CMND và CCCD để hiển thị thông tin giấy phép lái xe trong tài khoản định danh điện tử VNEID. Đối với người dân, để chủ động, ông Lê Mạnh Hà cho biết, người dân có giấy phép lái xe (mẫu giấy) nên cấp đổi lại bằng lái xe để được cập nhật hoặc điều chỉnh thông tin cá nhân bị sai lệch, từ đó có thông tin đầy đủ, chính xác cập nhật vào hệ thống cơ sở dữ liệu giấy phép lái xe của Bộ Giao thông Vận tải, là cơ sở để được xác thực và cập nhật vào tài khoản định danh mức độ 2 VNEID.
Ngoài ra, vận động, tổ chức cấp tài khoản định danh điện tử VNEID hiện nay đang được Công an thành phố tập trung tổ chức thực hiện theo chỉ đạo của Bộ Công an nhằm đẩy mạnh, nâng cao hiệu quả Đề án 06 của Chính phủ, đem lại tiện ích ngày càng tốt hơn cho người dân.
Tính đến nay, Công an TP Hồ Chí Minh đã thu nhận được 4.009.959 tài khoản định danh điện tử, trong đó mức 1 là 581.070; mức 2 là 3.442.889, người dân đã kích hoạt, sử dụng thành công 1.964.318 tài khoản. Trong đó, mức 1 là 163.074 tài khoản; mức 2 là 1.801.244 tài khoản.