Để thực hiện các biện pháp đảm bảo trật tự an toàn giao thông và chấp hành các quy định của pháp luật về kinh doanh và đăng ký kinh doanh vận tải, tỉnh Phú Yên đã đề nghị Bộ Giao thông Vận tải cần bổ sung thêm các điều kiện về quy mô, phương pháp tổ chức, quản lý kinh doanh vận tải đối với các doanh nghiệp vận tải hành khách tuyến cố định từ 300 km trở lên và kinh doanh vận tải hàng hóa bằng côngtennơ, taxi; có chế độ chính sách ưu đãi đối với các hợp tác xã kinh doanh vận tải trong đào tạo và bồi dưỡng nhân lực, thuế, phí, các chế độ bảo hiểm.
Hiện nay, tỉnh Phú Yên có 474 xe vận tải khách tuyến cố định, xe hợp đồng, xe buýt, taxi và côngtennơ của 29 doanh nghiệp, trong đó có 127 xe của 14 đơn vị vận tải khách tuyến cố định, 36 xe buýt của 2 đơn vị, 108 xe taxi của 3 đơn vị, 25 xe vận tải hợp đồng của 25 đơn vị, 2 xe côngtennơ vận chuyển hàng hóa của 2 đơn vị và 8 bến xe.
Mặc dù Sở Giao thông Vận tải tỉnh Phú Yên đã thực hiện bảo đảm các hoạt động về quản lý và cấp giấy phép kinh doanh vận tải, mở tuyến và công bố tuyến cố định... nhưng vẫn còn tình trạng lái xe chạy quá tốc độ; một số bến xe không đảm bảo về cơ sở vật chất như thiếu điện chiếu sáng, nhà chờ thiếu diện tích; chưa khám sức khỏe định kỳ và đóng Bảo hiểm xã hội đầy đủ cho lái xe và nhân viên phục vụ trên xe...