Tại phiên tòa phúc thẩm, trong quá trình xét xử, bị cáo Khương Ngọc Chất đã xin thay đổi nội dung từ kháng cáo kêu oan sang kháng cáo xin giảm nhẹ hình phạt; bị cáo Nguyễn Quang Vinh xin thay đổi nội dung kháng cáo từ kêu oan sang kháng cáo đề nghị xem xét lại tội danh và mức hình phạt. Trong vụ án này, bị cáo Nguyễn Quang Vinh chỉ thừa nhận hành vi “Thiếu trách nhiệm trong khi thi hành công vụ gây hậu quả nghiêm trọng”, không nhận tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”.
Sau khi xem xét toàn diện nội dung vụ án, căn cứ vào tính chất mức độ, hành vi phạm tội và thái độ thành khẩn khai báo, ăn năn hối lỗi của các bị cáo, Hội đồng xét xử Tòa án nhân dân cấp cao đã chấp nhận kháng cáo của các bị cáo Khương Ngọc Chất và Đỗ Mạnh Tuấn, sửa một phần bản án sơ thẩm và tuyên phạt bị cáo Khương Ngọc Chất mức án 5 năm tù (giảm 1 năm so với bản án sơ thẩm) về tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”.
Hội đồng xét xử tuyên phạt bị cáo Đỗ Mạnh Tuấn mức án 6 năm tù về tội “Nhận hối lộ” (giảm 1 năm so với bản án sơ thẩm) và giữ nguyên mức án 3 năm tù về tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”, tổng hợp hình phạt cho cả 2 tội danh mà bị cáo Đỗ Mạnh Tuấn phải chấp hành là 9 năm tù giam. Hội đồng xét xử không chấp nhận kháng cáo, giữ nguyên mức hình phạt 8 năm tù về tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ” như bản án sơ thẩm đã tuyên đối với bị cáo Nguyễn Quang Vinh.
Trước đó, trong các ngày từ 11 - 21/5/2020, Tòa án nhân dân tỉnh Hòa Bình đã đưa ra xét xử 15 bị cáo với các tội danh: “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”; “Nhận hối lộ” và “Đưa hối lộ”, tác động, can thiệp chỉnh sửa đáp án nâng điểm 145 bài thi của 58 thí sinh trong kỳ thi Trung học phổ thông Quốc gia năm 2018 tại Hòa Bình.
Kết thúc phiên tòa sơ thẩm, Hội đồng xét xử Tòa án nhân dân tỉnh Hòa Bình đã tuyên phạt 51 năm tù cho các bị cáo. Trong đó, bị cáo Nguyễn Quang Vinh với vai trò chủ mưu đã bị xử phạt 8 năm tù; bị cáo Khương Ngọc Chất bị xử phạt 6 năm tù; bị cáo Đỗ Mạnh Tuấn bị xem xét, xử lý trách nhiệm hình sự với 2 tội danh “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ” và tội “Nhận hối lộ” với tổng hình phạt là 10 năm tù (riêng tội “Nhận hối lộ” bị tuyên phạt mức án 7 năm tù).
Sau đó, các bị cáo Nguyễn Quang Vinh, Khương Ngọc Chất đã có kháng cáo kêu oan và bị cáo Đỗ Mạnh Tuấn, Nguyễn Thị Thu Loan có đơn kháng cáo xin giảm nhẹ hình phạt. Tuy nhiên, trước khi diễn ra phiên tòa phúc thẩm, bị cáo Nguyễn Thị Thu Loan đã xin rút toàn bộ đơn kháng cáo.