Theo đó, ô tô trên đường Vành đai 3 trên cao (hướng Pháp Vân đi cầu Thăng Long) có nhu cầu đi Nghiêm Xuân Yêm, Nguyễn Hữu Thọ, Linh Đường và Trung tâm Hà Nội đi theo hướng: Vành đai 3 trên cao rẽ phải đi theo nhánh ram xuống của cầu phía trái tại Km -1+120.25 (Lý trình đường Vành đai 3 trên cao).
Các phương tiện xe ô tô từ Nguyễn Xiển, Nghiêm Xuân Yêm, Nguyễn Hữu Thọ có nhu cầu đi đường Vành đai 3 trên cao (hướng đi Pháp Vân) đi theo hướng: từ nút giao Nghiêm Xuân Yêm - Nguyễn Hữu Thọ đi theo nhánh ram lên của cầu phía phải tại Km -1+120.25 lên Vành đai 3 trên cao.
Các phương tiện giao thông đường bộ từ Nghiêm Xuân Yêm đi Hoàng Liệt theo hướng: qua cầu vượt hồ Linh Đàm đi thấp nhánh bên phải gồm 2 làn xe cơ giới, 1 làn hỗn hợp. Các phương tiện giao thông đường bộ từ Hoàng Liệt đi Nghiêm Xuân Yêm, Nguyễn Trãi sẽ đi theo cầu vượt hồ Linh Đàm đi thấp nhánh trái gồm 2 làn xe cơ giới, 1 làn hỗn hợp.
Sở Giao thông Vận tải Hà Nội sẽ tổ chức đóng lối dẫn ra, vào tại làn đường dành cho xe máy của dự án để phục vụ công tác hoàn thiện theo thiết kế được duyệt. Tại nút giao Nghiêm Xuân Yêm - Nguyễn Hữu Thọ, công tác tổ chức giao thông sẽ được triển khai bằng đèn tín hiệu giao thông trung tâm nút.
Cụ thể, các phương tiện giao thông đường bộ từ Nghiêm Xuân Yêm đi Vành đai 3 trên cao, Hoàng Liệt, Giải Phóng, Khu đô thị Linh Đàm di chuyển theo hướng: Qua nút đèn tín hiệu giao thông đi thẳng theo nhánh ram lên đi Vành đai 3 trên cao; qua nút đèn tín hiệu giao thông đi thẳng qua cầu vượt Hồ Linh Đàm đi Hoàng Liệt; qua nút đèn tín hiệu giao thông rẽ trái đi Nguyễn Hữu Thọ - Giải Phóng; rẽ phải tại làn rẽ phải liên tục đi Nguyễn Hữu Thọ - Khu đô thị Linh Đàm.
Đối với các phương tiện giao thông đường bộ từ Giải Phóng - Nguyễn Hữu Thọ đi Khu đô thị Linh Đàm, Vành đai 3 trên cao, Hoàng Liệt, Nghiêm Xuân Yêm theo các hướng: Qua nút đèn tín hiệu giao thông đi thẳng đi Khu đô thị Linh Đàm; rẽ phải liên tục và quay đầu tại điểm mở dải phân cách trên đường Nghiêm Xuân Yêm và qua nút đèn tín hiệu giao thông đi thẳng theo nhánh ram lên đi Vành đai 3 trên cao hoặc qua cầu vượt Hồ Linh Đàm đi Hoàng Liệt; rẽ phải liên tục đi Nghiêm Xuân Yêm - Nguyễn Xiển.
Các phương tiện giao thông đường bộ từ Khu đô thị Linh Đàm - Nguyễn Hữu Thọ đi Giải Phóng, Nghiêm Xuân Yêm, Vành đai 3 trên cao, Linh Đường theo các hướng: Qua nút đèn tín hiệu giao thông đi thẳng đi Nguyễn Hữu Thọ, Giải Phóng; qua nút đèn tín hiệu giao thông rẽ trái đi Nghiêm Xuân Yêm, Nguyễn Xiển; rẽ phải tại làn rẽ phải liên tục đi thẳng theo nhánh ram lên đi Vành đai 3 trên cao hoặc qua cầu vượt Hồ Linh Đàm đi Hoàng Liệt.
Các phương tiện từ cầu vượt hồ Linh Đàm và ram xuống của Vành đai 3 trên cao đi Nghiêm Xuân Yêm, Nguyễn Hữu Thọ, Khu đô thị Linh Đàm, Giải Phóng đi theo các hướng: qua nút đèn tín hiệu giao thông đi thẳng Nghiêm Xuân Yêm, Nguyễn Xiển; qua nút đèn tín hiệu giao thông đi thẳng, quay đầu tại điểm mở dải phân cách trên đường Nghiêm Xuân Yêm, rẽ phải đi Khu đô thị Linh Đàm và qua nút đèn tín hiệu giao thông rẽ trái đi Nguyễn Hữu Thọ, Giải Phóng.
Cấm các phương tiện từ cầu vượt hồ Linh Đàm và ram xuống của Vành đai 3 trên cao rẽ trái ra đường Nguyễn Hữu Thọ đi Khu đô thị Linh Đàm và cấm các phương tiện từ ram xuống của Vành đai 3 trên cao rẽ phải tại làn rẽ phải liên tục ra đường Nguyễn Hữu Thọ đi Giải Phóng. Các phương tiện từ Hoàng Liệt qua cầu vượt hồ Linh Đàm được phép rẽ phải tại làn rẽ phải liên tục đi Nguyễn Hữu Thọ - Giải Phóng.
Ngoài ra, tại nút giao Linh Đường, giao thông sẽ được tổ chức bằng đảo giao thông dẫn hướng. Các phương tiện giao thông đường bộ đi từ Linh Đường ra Nguyễn Hữu Thọ và ngược lại thông qua hệ thống đảo giao thông, biển báo chỉ dẫn tại khu vực trung tâm nút.