Trạm bơm Yên Nghĩa là công trình do Trung tâm Khoa học và Triển khai kỹ thuật thủy lợi (Trung tâm Khoa học) đề xuất xây dựng trong quá trình nghiên cứu lập Quy hoạch tiêu nước cho Hệ thống thủy lợi Sông Nhuệ (Quy hoạch). Quy hoạch nói trên được Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn phê duyệt tại Quyết định số 2048/QĐ-BNN ngày 18/7/2007. Theo đó, Trạm bơm Yên Nghĩa là công trình tiêu nước quan trọng nhất của Quy hoạch được ưu tiên đầu tư xây dựng trước.
Do tính cấp bách, tầm quan trọng và quy mô của trạm bơm, theo đề nghị của Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn, ngay sau khi Quy hoạch được duyệt, Trung tâm Khoa học đã hoàn thành bản “Đề cương chi tiết Dự án cải thiện năng lực tiêu nước cho khu vực phía tây Thủ đô Hà Nội thuộc Hệ thống Thủy lợi Sông Nhuệ” (Báo cáo Tiền khả thi dự án Trạm bơm tiêu Yên Nghĩa).
Hồ sơ dự án được Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn gửi tới Ngân hàng Quan hệ Quốc tế Nhật Bản (JBIC), Đại sứ quán Nhật Bản và các cơ quan chức năng của Việt Nam có liên quan như Vụ Hợp tác Quốc tế - Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn, Bộ Kế hoạch và Đầu tư, để làm thủ tục vay vốn đầu tư.
Video toàn cảnh trạm bơm tiêu nước lớn nhất Hà Nội được ghi nhận vào tháng 7/2023:
Công trình đầu mối Trạm bơm Yên Nghĩa do Công ty Tư vấn và Chuyển giao công nghệ Trường Đại học Thủy lợi khảo sát và thiết kế, với lưu lượng thiết kế 120 m3/giây, Yên Nghĩa là trạm bơm tiêu có quy mô lớn nhất nước ta hiện nay.
Ngày 24/12/2015, tại xã Đông La, huyện Hoài Đức, UBND TP Hà Nội đã tổ chức lễ khởi công dự án “Cải thiện hệ thống tiêu nước khu vực phía tây TP Hà Nội” (gồm kênh dẫn nước La Khê và trạm bơm Yên Nghĩa), với tổng mức đầu tư 7.466 tỷ đồng. Theo kế hoạch, toàn bộ dự án sẽ hoàn thành đưa vào khai thác vào cuối năm 2022.
Sau 5 năm thi công, đến tháng 1/2020, dự án hoàn thành với 10 tổ máy, có công suất 120m3/giây. Nhưng từ đó đến nay, trạm bơm hoạt động cầm chừng; khu vực phía Tây Hà Nội bao gồm các quận huyện Thanh Xuân, Hà Đông, Nam Từ Liêm, Đan Phượng… vẫn chịu cảnh ngập úng.
Hội đồng nhân dân (HĐND) TP Hà Nội đã nhiều lần chất vấn về tiến độ của dự án này. Lần gần đây nhất là vào sáng 5/7, tại kỳ họp thứ 12 của HĐND TP Hà Nội khóa XVI, ông Nguyễn Ngọc Tuấn, Chủ tịch HĐND TP Hà Nội khẳng định: “Bây giờ chậm như vậy thì tiến độ sẽ như thế nào? Chậm quá!”.
Trước đó vào kỳ họp HĐND TP Hà Nội thứ 10 (tháng 8/2022), UBND TP Hà Nội đã cam kết hết năm 2022 sẽ giải phóng xong mặt bằng (GPMB) để năm 2023 tiếp tục triển khai phần còn lại của dự án. Tuy nhiên, đến nay, công tác GPMB kênh dẫn nước La Khê vẫn chưa hoàn thành, khiến cả dự án dậm chân tại chỗ.