Để bảo đảm an toàn chạy tàu và phù hợp với điều kiện thực tế, ngành Đường sắt buộc phải điều chỉnh kế hoạch chạy tàu khách.
Lãnh đạo Bộ Xây dựng và ngành Đường sắt chỉ đạo khắc phục các vị trí đường sắt bị hư hỏng.
Cụ thể: Tạm ngừng chạy tàu SE6/SE5 xuất phát tại ga Sài Gòn và ga Hà Nội từ ngày 2/12 đến hết ngày 10/12/2025; tạm ngừng chạy tàu SE22/SE21 xuất phát tại ga Sài Gòn và ga Đà Nẵng vào các ngày 2, 3, 4, 8, 9 và 10/12/2025.
Theo Tổng công ty đường sắt Việt Nam, trong đợt mưa lũ lịch sử khu vực Nam Trung Bộ (ùn tắc đường sắt từ 17/11 - 25/11), làm hư hỏng hạ tầng đường sắt kéo dài từ Diêu Trì đến Nha Trang. Đến ngày 1/12/2025, ngành Đường sắt đã thông báo ngừng chạy 105 đoàn tàu khách (từ 17/11 - 10/12/2025) và 65 đoàn tàu hàng.
Ngành Đường sắt đã phục vụ ăn uống miễn phí cho hành khách trên các đoàn tàu bị ảnh hưởng 35.000 suất ăn, số lượng vé tàu đã thực hiện trả lại cho hành khách 39.000 vé, tương đương số tiền khoảng 24 tỷ đồng. Ước tính thiệt hại tàu khách và hàng khoảng 50 tỷ đồng.