Ông Vũ Hải Quân sinh năm 1974 tại Ninh Bình. Ông tốt nghiệp Khoa toán-tin, Trường Đại học Khoa học tự nhiên (Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh) năm 1996.
Từ năm 2001 - 2005, ông Vũ Hải Quân làm nghiên cứu sinh tại Trường Đại học Tổng hợp Trento, Italy và đạt học vị tiến sĩ.
Sau đó, ông Quân tiếp tục nghiên cứu sau tiến sĩ tại Trường Đại học Leuven, Bỉ. Tháng 2/2005, ông bảo vệ thành công luận án tiến sĩ và nhận học bổng postdoc ở Đại học Tổng hợp Leuven.
Trở về nước năm 2007, ông Quân lần lượt giữ nhiều chức vụ như: Giám đốc Trung tâm Đào tạo quốc tế ITEC và trưởng phòng thí nghiệm trí tuệ nhân tạo AILab, Phó Hiệu trưởng Trường Đại học Khoa học tự nhiên (Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh).
Ngày 5/10/2017, ông được Thủ tướng Chính phủ bổ nhiệm giữ chức vụ Phó Giám đốc Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh.