Từ ngày 17/6/2021, ngành đường sắt bắt đầu chạy lại đôi tàu khách Thống nhất SE3/SE4 trên tuyến Hà Nội -Thành phố Hồ Chí Minh, tàu SE3 xuất phát ga Hà Nội lúc 19 giờ 15 và tàu SE4 xuất phát từ ga Sài Gòn lúc 19 giờ 25. Như vậy, trên tuyến này hiện có 2 đôi tàu khách SE3/SE4 và SE7/SE8 chạy hàng ngày.
Thực hiện chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ (Chỉ thị 16/CT-TTg) và Bộ Giao thông vận tải về triển khai các biện pháp cấp bách phòng, chống dịch COVID-19, từ 0 giờ ngày 1/4 - 15/4, Tổng công ty Đường sắt Việt Nam (VNR) chỉ duy trì 1 đôi tàu khách SE3/4 trên tuyến đường sắt Bắc Nam.