Để tổ chức Đại hội Thể dục thể thao học sinh Đông Nam Á lần thứ 13 chu đáo, an toàn, Ban Tổ chức Đại hội đã lên kế hoạch chuẩn bị về các khâu nhân sự phục vụ, cơ sở vật chất kỹ thuật, nơi ăn ở, an ninh trật tự… trong nhiều tháng. Nhờ vậy, Đại hội đã tạo ấn tượng tốt đối với các đoàn thể thao trong khu vực.