Cho phép các loài được theo dõi dựa trên các dấu vết di truyền để lại trên đường đi của chúng, giải trình tự DNA môi trường đang trở nên phổ biến chưa từng có. Được phát triển vào những năm 2000, kỹ thuật này hiện đang mở ra nhiều lĩnh vực ứng dụng mới.