Theo cơ quan chức năng, hiện trường vụ cháy trên rộng khoảng 900 m2. Các căn nhà bị cháy hầu hết là nhà tạm, cơi nới, không đảm bảo về kết cấu xây dựng. Toàn bộ hệ thống khung thép, mái tôn bị sập do tác động của nhiệt khi cháy. Vì vậy, công tác khám nghiệm hiện trường gặp nhiều khó khăn và mất nhiều thời gian.
Từ kết quả khám nghiệm hiện trường, cơ quan chức năng sơ bộ nhận định, nguyên nhân cháy hàng loạt ngôi nhà ở gần Bệnh viện Nhi Trung ương (Hà Nội) là do chập điện. Điểm cháy xuất phát tại nhà ông Nguyễn Thế Hiệp (tức Hiệp "khùng", SN 1947, trú tại tổ 15 cụm 5 phường Ngọc Khánh, Ba Đình - Hà Nội) và cũng là hiện trường chính. Ông Hiệp thuê lại 4 nhà của 2 chủ hộ khác để cho thuê trọ, trong các nhà, mỗi tầng được ngăn thành nhiều phòng nhỏ.
Chiều 21/9, tại hiện trường vụ cháy, cơ quan chức năng phát hiện 2 vật hình hộp sọ nằm dưới hệ thống khung sắt và mái tôn bị sập đổ của tầng 2 của khu trọ nhà ông Hiệp. Cơ quan chức năng tiến hành tháo dỡ các kết cấu khung sắt, xác định đó là 2 tử thi bị cháy đen không thể nhận dạng được.
Kết quả pháp y tử thi, ban đầu nhận định 2 nạn nhân gồm 1 nam và nữ; nguyên nhân tử vong do ngạt khí CO. Những phần còn lại của cơ thể nạn nhân bị ảnh hưởng bởi nhiệt độ cao, không phát hiện dấu vết của ngoại lực tác động.
Cơ quan điều tra đã tiến hành ghi lời khai của những hộ dân xung quanh và những người liên quan, đồng thời làm việc với Bệnh viện Nhi trung ương, xác định có 1 cháu bé tên là T.C.M (sinh ngày 1/7/2018) đang điều trị tại khoa Hồi sức tích cực có bố là Tạ Văn Tính (SN 1976) và mẹ là Hạ Thị Lành (SN 1977), quê quán thị trấn Thanh Sơn, Phú Thọ.
Thời gian từ chiều tối ngày 17/9 (thời điểm xảy ra vụ cháy) đến nay không thấy anh Tính và chị Lành vào chăm sóc bé M, cũng không liên lạc được bằng điện thoại. Cơ quan Công an đã làm việc với Công an thị trấn Thanh Sơn, xác định có việc vợ chồng anh Tính đưa con về Hà Nội chữa bệnh, hiện nay chưa về.
Công an thành phố Hà Nội đang chỉ đạo Cơ quan điều tra Công an quận Ba Đình phối hợp với các đơn vị chức năng khẩn trương điều tra, kết luận nguyên nhân xảy ra vụ cháy và làm rõ nhân thân, lai lịch, nguyên nhân tử vong của 2 nạn nhân, xử lý vụ việc theo quy định của pháp luật.
Trước đó, như đã thông tin, khoảng 18h chiều 17/9, một vụ cháy lớn đã xảy ra ở khu vực gần cổng Bệnh viện Nhi Trung ương (phường Ngọc Khánh, quận Ba Đình). Đám cháy sau đó lan nhanh ra các nhà ở mặt đường Đê La Thành và đến khoảng 21h cùng ngày ngọn lửa được dập tắt.
Đám cháy đã thiêu rụi 19 căn nhà, 31 hộ với 99 nhân khẩu chịu thiệt hại từ vụ hỏa hoạn.