Theo Trung tâm Bão quốc gia Mỹ, bão Rafael sẽ tiếp tục gia tăng cường độ trước khi quét qua khu vực miền Tây Cuba ngày 6/11 với sức gió tối đa dự kiến lên tới 160 km/giờ. Bão Rafael được dự đoán sẽ đi qua gần thủ đô La Habana của Cuba và đe dọa gây thiệt hại lớn cho nhà ở và các cơ sở hạ tầng tại đây. Cơ quan này cũng đưa ra cảnh báo tình trạng nước triều dâng nguy hiểm và các cơn sóng gây thiệt hại lớn đối với Quần đảo Cayman, song chưa xác định mức độ ảnh hưởng của cơn bão đến nước Mỹ.
Từ đầu tuần, các nhà chức trách đã sơ tán hơn 66.000 người Cuba ở tỉnh Guantanamo, vùng cực Đông nước này, nơi dự báo sẽ đối mặt với mưa lớn và lũ lụt. Theo giới chức, kết cấu đất ở tỉnh này đã rất yếu sau đợt lũ lụt do bão Oscar gây ra. Hàng nghìn cư dân ở tỉnh Pinar del Rio, ở cực Tây của quốc đảo này cũng đang lên kế hoạch sơ tán. Một số tỉnh của Cuba đã tạm dừng một phần hoặc toàn bộ các lớp học, trong khi Bộ Giao thông Cuba đã chỉ đạo tạm dừng hoạt động một số tuyến xe buýt và đường sắt.
Tính đến 7h sáng theo giờ Việt Nam, bão Rafael ở cách Kingston, Jamaica hơn 230 km về phía Nam, với sức gió mạnh nhất liên tục là 75 km/giờ. Đây là cơn bão thứ 17 được đặt tên trong mùa bão Đại Tây Dương, khu vực vốn mỗi năm có trung bình 14 cơn bão được đặt tên.