Theo thống kê, tổng cộng có 125 trường hợp có biểu hiện ngộ độc sau khi ăn bánh mì tại cơ sở này. Ngay sau khi xảy ra vụ việc, UBND phường Phú Mỹ đã phối hợp với Sở An toàn thực phẩm Thành phố Hồ Chí Minh, Trung tâm Y tế khu vực và lực lượng công an tiến hành kiểm tra cơ sở; đồng thời điều tra, làm rõ nguyên nhân vụ ngộ độc. Cơ quan chức năng đã lấy 9 mẫu thực phẩm tại tiệm bánh mì Ngọc Hà để gửi xét nghiệm theo quy định.
Vào cuộc kiểm tra, cơ quan chức năng phát hiện cơ sở này không có Giấy chứng nhận đủ điều kiện an toàn thực phẩm, Giấy xác nhận tập huấn kiến thức an toàn thực phẩm, giấy khám sức khỏe của chủ và nhân viên dù mỗi ngày bán ra tới 800 ổ bánh mì. Cơ sở này cũng không xuất trình được hợp đồng mua bán nguyên liệu như: bánh mì, rau thơm, dưa leo… Chủ tiệm bánh mì Ngọc Hà đã bị UBND phường Phú Mỹ xử phạt 15 triệu đồng.