Ngoài án phạt tù, Tòa còn tuyên buộc bị cáo Liên phải hoàn trả số tiền chiếm đoạt còn lại cho bị hại.
Theo cáo trạng của Viện Kiểm sát nhân dân thành phố Hà Nội, năm 2007, Bùi Kim Liên thành lập và làm Giám đốc Công ty cổ phần đầu tư bất động sản Thuận Thành, chuyên kinh doanh bất động sản. Năm 2009, Liên có quan hệ quen biết với bà Trần Thị Ngọc Khanh (Chủ tịch Hội đồng quản trị kiêm Tổng Giám đốc Công ty cổ phần xây dựng và thương mại Hoàng Hải) cũng làm nghề kinh doanh bất động sản.
Tháng 6/2009, Liên muốn mua 20 ô đất liền kề D7-D11 tại Khu đô thị mới Lê Trọng Tấn - Geleximco (ở quận Hà Đông và huyện Hoài Đức, Hà Nội) để kinh doanh nhưng không được. Tuy nhiên, Bùi Kim Liên vẫn nói với bà Trần Thị Ngọc Khanh rằng Công ty cổ phần đầu tư bất động sản Thuận Thành đang là nhà đầu tư thứ phát tại dự án Khu đô thị mới Lê Trọng Tấn - Geleximco. Liên nhờ bà Khanh môi giới bán đất tại dự án này, kèm theo lời hứa sẽ trả hoa hồng cho bà Khanh.
Khoảng tháng 10/2009, ông Trần Ngọc Hải (trú tại quận Đống Đa, Hà Nội) có nhu cầu mua đất và quen biết với ông Nguyễn Văn Toàn, Giám đốc Công ty môi giới Bất động sản 24h. Ông Toàn biết Công ty cổ phần xây dựng và thương mại Hoàng Hải rao bán đất ở Khu đô thị mới Lê Trọng Tấn - Geleximco nên giới thiệu ông Hải đến gặp bà Khanh. Bà Khanh lại giới thiệu ông Hải đến gặp Bùi Kim Liên để trao đổi việc mua bán đất.
Cơ quan tố tụng xác định, Công ty cổ phần đầu tư bất động sản Thuận Thành (do Bùi Kim Liên là Giám đốc) không phải là Công ty thứ phát cho Công ty cổ phần Xuất nhập khẩu tổng hợp Hà Nội (Geleximco) - Chi nhánh Hà Tây. Bùi Kim Liên không có và không được phép bán nhà, đất tại các ô đất số 10, 11, 12 thuộc Lô D22 khu D, dự án Khu đô thị mới Lê Trọng Tấn - Geleximco. Do có ý định chiếm đoạt tiền của người khác nên Bùi Kim Liên đã thông qua bà Trần Thị Ngọc Khanh để đưa ra thông tin không đúng sự thật, nói với ông Trần Ngọc Hải về việc Công ty Thuận Thành là nhà đầu tư thứ phát cho chủ đầu tư dự án Khu đô thị mới Lê Trọng Tấn - Geleximco, để ông Hải tin tưởng ký hợp đồng mua 3 ô đất số 10, 11, 12 Lô D22 khu D Khu đô thị mới Lê Trọng Tấn - Geleximco.
Liên đã soạn thảo và ký 3 hợp đồng vay vốn với ông Hải, nội dung hợp đồng thể hiện ông Hải được quyền mua 3 ô đất có ô, lô, khu, có sơ đồ lô chi tiết rõ ràng cho 3 ô đất số 10, 11, 12 Lô D22 khu D dự án Khu đô thị mới Lê Trọng Tấn - Geleximco, do Công ty cổ phần Xuất nhập khẩu tổng hợp Hà Nội (Geleximco) làm chủ đầu tư. Tổng số tiền ông Hải đã nộp là hơn 9 tỷ đồng.
Tuy nhiên, sau khi nhận tiền của ông Hải, Liên đã không thực hiện các thỏa thuận trong hợp đồng, không liên hệ với chủ đầu tư để mua các lô đất trên cho ông Hải. Đến cuối năm 2011, khi bị ông Hải phát hiện và đòi lại tiền, Liên mới chỉ trả cho ông Hải 1,9 tỷ đồng. Số tiền còn lại, Liên chiếm đoạt sử dụng chi tiêu cá nhân hết.
Hội đồng xét xử cũng kiến nghị Cơ quan điều tra tiếp tục làm rõ hành vi, vai trò của bà Trần Thị Ngọc Khanh trong vụ án.
