Bão đã làm 16 ngôi nhà bị tốc mái, 2 trụ sở cơ quan tại thị xã Ninh Hòa bị hư hỏng, 3 nhà màng công nghệ cao của Trại thực nghiệm Suối Dầu (xã Suối Cát, huyện Cam Lâm) bị sập, hư hỏng; 1 tàu đánh cá bị chìm dù được neo đậu tại khu vực tránh trú bão ở phường Vĩnh Trường, thành phố Nha Trang. Bên cạnh đó, nhiều diện tích cây trồng, lúa, hoa màu bị ngã đổ, ngập úng; cây cối trong các khu dân cư tại các địa phương bị ngã đổ khá nhiều.
Bão số 12 cũng đã gây ra các sự cố về điện, khiến cho toàn bộ huyện miền núi Khánh Vĩnh bị mất điện; các xã: Vạn Khánh, Vạn Long, Vạn Thọ, Vạn Phước và Đại Lãnh thuộc huyện Vạn Ninh, hai xã Ninh vân và Ninh Phước của thị xã Ninh Hòa cũng bị mất điện.
Tàu SE2 di chuyển theo hướng từ Nam ra Bắc đang phải tạm dừng tại lý trình 1233+600 (huyện Vạn Ninh), do đường sắt khu vực này bị ngập nước. Toàn bộ hành khách và nhân viên tàu vẫn an toàn trên tàu, với số lượng lương thực, thực phẩm dự trữ đủ dùng trong 2 ngày.
Hiện nay, trong tổng số 19 hồ chứa nước có lưu lượng nước tích lớn, lượng nước đạt trung bình từ 60 - 70% dung tích thiết kế, cá biệt một số hồ đã đạt lượng nước trên 90%. Một số hồ chứa nước đã bắt đầu xả lũ để đón lũ mới do được dự báo hoàn lưu bão số 12 sẽ tiếp tục gây mưa lớn trên địa bàn tỉnh.
Riêng hồ Hoa Sơn (huyện Vạn Ninh) đã xả 283 m3/s vào trưa nay, chính quyền địa phương đã thực hiện di dời 57 hộ với khoảng 220 khẩu tại xã Vạn Lương đến khu vực an toàn để phòng tránh tình trạng ngập nặng do việc xả nước nói trên.
