Công trình có cấp thiết kế là cấp II theo QCVN 04-05:2012/BNNPTNT.
Theo Bộ Công Thương, thủy điện Hồi Xuân có nhiệm vụ trong mùa lũ phải đảm bảo an toàn công trình, không để mực nước hồ chứa vượt mực nước lũ kiểm tra ở cao trình 86,05m với mọi trận lũ có chu kỳ lặp lại nhỏ hơn hoặc bằng 500 năm; góp phần đảm bảo an toàn chống lũ cho hạ du; đảm bảo hiệu quả phát điện và góp phần đảm bảo hiệu quả cấp nước cho hạ du.
Ngoài ra, trong mùa cạn, thủy điện Hồi Xuân cũng phải đảm bảo an toàn công trình; đảm bảo dòng chảy tối thiểu trên sông và góp phần đảm bảo nhu cầu sử dụng nước ở hạ du; đảm bảo hiệu quả phát điện.
Quyết định cũng nêu rõ quy định về phân loại lũ và thời kỳ mùa lũ, mùa cạn để áp dụng các quy định vận hành đối với công trình thủy điện Hồi Xuân.
Cụ thể phân loại lũ chia thành 4 loại như lũ nhỏ và vừa có lưu lượng đỉnh lũ từ 670m3/s đến 2930 m3/s. Lũ lớn có lưu lượng đỉnh lũ lớn hơn 2930 m3/s đến nhỏ hơn 6000 m3/s. Lũ đặc biệt lớn có lưu lượng đỉnh lũ từ 6000 m3/s đến nhỏ hơn 7000 m3/s. Lũ lịch sử có lưu lượng đỉnh lũ lớn hơn hoặc bằng 7000 m3/s.
Mặt khác, quy định về thời kỳ mùa lũ, mùa cạn cũng chia thành hai mùa. Mùa lũ từ ngày 15 tháng 7 đến ngày 15 tháng 11 hàng năm. Mùa cạn từ ngày 16 tháng 11 năm trước đến 14 tháng 7 năm sau.
