Theo nội dung vụ án, Nguyễn Tuấn Thanh được phân công thụ lý, xác minh nguồn tin về tội phạm theo đơn bà H.T.H. tố cáo bà V.T.H. có hành vi lừa đảo chiếm đoạt tài sản.
Quá trình xác minh nguồn tin, khoảng ngày 05/11/2020 (không nhớ chính xác ngày), Thanh có báo cáo đề xuất gửi Ban Chỉ huy Đội 8 Phòng PC02 cho ý kiến để trình lãnh đạo Cơ quan Cảnh sát điều tra về việc khởi tố vụ án "Làm giả con dấu, tài liệu của cơ quan, tổ chức".
Khi gần hết thời hạn xác minh nguồn tin nhưng chưa nhận được phê duyệt đề xuất của lãnh đạo Công an Thành phố Hồ Chí Minh, Thanh lo sợ nguồn tin về tội phạm bị quá thời hạn không được giải quyết sẽ bị Viện Kiểm sát kiến nghị, dẫn đến ảnh hưởng đến thành tích của bản thân, Thanh đã in các văn bản tố tụng đã được soạn sẵn trên máy tính cá nhân, cắt dán chữ ký Chỉ huy Đội 8 Phòng Cảnh sát Hinhf sự và chữ ký của Lãnh đạo Cơ quan Cảnh sát điều tra, tự ghi số, ngày và tự đóng dấu của Cơ quan Cảnh sát điều tra để làm giả văn bản tố tụng của Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an Thành phố.
Nguyễn Tuấn Thanh đã làm giả 4 văn bản, gồm: Quyết định khởi tố vụ án hình sự số 914-01, Công văn về việc kiểm sát Quyết định khởi tố vụ án hình sự số 12910 gửi Viện Kiểm sát nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh, Quyết định phân công Phó Thủ trưởng Cơ quan điều tra tiến hành khởi tố, điều tra vụ án hình sự số 914-57, Quyết định phân công Điều tra viên, cán bộ điều tra tiến hành điều tra vụ án hình sự số 914-10.
Sau khi có ý kiến chỉ đạo của Công an Thành phố về việc chuyển hồ sơ vụ án trên sang cho Phòng PC01 để thụ lý điều tra vụ án, Thanh đưa các văn bản tố tụng do mình làm giả trên vào hồ sơ nguồn tin để chuyển đến Viện Kiểm sát nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh để kiểm sát và chuyển đến Phòng PC01 thụ lý, điều tra vụ án.
Tuy nhiên, Phòng PC01 khi tiếp nhận hồ sơ thấy còn thiếu nhiều tài liệu tố tụng nên gửi công văn sang Phòng PC02 yêu cầu bổ sung. Từ đó, PC02 tiến hành kiểm tra thì phát hiện ra sai phạm của Thanh. Ngày 26/8/2022, Thanh bị Cơ quan điều tra Viện Kiểm sát nhân dân tối cao khởi tố.
Ngoài ra, Nguyễn Tuấn Thanh còn làm giả văn bản tố tụng là Thông báo về việc khám xét khẩn cấp, Thanh mới in văn bản, cắt dán chữ ký của ông Trần Văn Phú, Phó Thủ trưởng, nhưng chưa ghi ngày, chưa lấy số và chưa đóng dấu của Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an Thành phố Hồ Chí Minh, mới chỉ ghi tháng 7 năm 2020 nên văn bản làm giả này chưa hoàn thành.